190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6928 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1027 aa  2107    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  30.75 
 
 
1019 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  28.46 
 
 
1020 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  26.96 
 
 
1019 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  25.73 
 
 
1018 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  25.07 
 
 
1015 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.47 
 
 
992 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.85 
 
 
983 aa  222  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 
929 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  23.79 
 
 
1028 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  23.4 
 
 
1028 aa  217  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  23.3 
 
 
1026 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  23.3 
 
 
1026 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.58 
 
 
987 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
1010 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
1010 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 
1006 aa  195  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  23.69 
 
 
985 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  24.08 
 
 
1008 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.64 
 
 
988 aa  192  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.64 
 
 
988 aa  192  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 
1009 aa  189  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  25.1 
 
 
1009 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 
1009 aa  189  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 
1009 aa  189  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.54 
 
 
988 aa  188  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.1 
 
 
1006 aa  187  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.27 
 
 
1015 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.4 
 
 
988 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.12 
 
 
988 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.5 
 
 
988 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.5 
 
 
988 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.5 
 
 
988 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.5 
 
 
988 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 
988 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  24.32 
 
 
988 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 
988 aa  181  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 
988 aa  181  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 
988 aa  181  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
990 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
990 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
990 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.57 
 
 
990 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.57 
 
 
990 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.15 
 
 
989 aa  179  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.09 
 
 
990 aa  179  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.97 
 
 
990 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.17 
 
 
989 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.83 
 
 
988 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
991 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  24.47 
 
 
988 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.88 
 
 
988 aa  173  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  24.17 
 
 
988 aa  172  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  23.31 
 
 
992 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  23.31 
 
 
992 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.57 
 
 
994 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.57 
 
 
994 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  22.36 
 
 
991 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  22.36 
 
 
991 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  23.56 
 
 
964 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.42 
 
 
994 aa  165  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.55 
 
 
999 aa  164  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.33 
 
 
755 aa  164  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 
988 aa  163  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  26.36 
 
 
996 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.76 
 
 
606 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.73 
 
 
976 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.08 
 
 
862 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  31.46 
 
 
338 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  27.62 
 
 
371 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.17 
 
 
550 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  26.25 
 
 
992 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  153  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  153  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 
996 aa  153  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.9 
 
 
988 aa  152  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
924 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  24.86 
 
 
771 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
988 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.69 
 
 
983 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.79 
 
 
997 aa  148  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.17 
 
 
772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  26.29 
 
 
1029 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.54 
 
 
961 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.75 
 
 
991 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.75 
 
 
991 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  23.77 
 
 
986 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.09 
 
 
573 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  26.28 
 
 
546 aa  137  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
994 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.57 
 
 
968 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  33.76 
 
 
246 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  29.78 
 
 
305 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  33.33 
 
 
246 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  26.41 
 
 
435 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  31.32 
 
 
310 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 
990 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  22.91 
 
 
979 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  21.84 
 
 
989 aa  127  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  22.34 
 
 
980 aa  126  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>