156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4353 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  82.32 
 
 
1008 aa  1744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  84.38 
 
 
1009 aa  1764    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1010 aa  2091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  35.28 
 
 
1018 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1010 aa  2091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  84.38 
 
 
1009 aa  1764    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  84.38 
 
 
1009 aa  1764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  84.38 
 
 
1009 aa  1764    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  33.5 
 
 
1015 aa  629  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  34.6 
 
 
1028 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 
1026 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 
1026 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  34.5 
 
 
1028 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  33.37 
 
 
929 aa  525  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
992 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  29.86 
 
 
1006 aa  452  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  27.29 
 
 
1015 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  88.95 
 
 
188 aa  343  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  29.6 
 
 
883 aa  342  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  28.83 
 
 
831 aa  336  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  41.11 
 
 
267 aa  202  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
1027 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  21.74 
 
 
1019 aa  186  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  22.96 
 
 
1020 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4638  transposase  62.39 
 
 
118 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.655234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  21.33 
 
 
1019 aa  154  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.7 
 
 
994 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.7 
 
 
994 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  22.58 
 
 
862 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.2 
 
 
983 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.26 
 
 
968 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  20.77 
 
 
988 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  20.77 
 
 
988 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  20.77 
 
 
988 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  20.77 
 
 
988 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  21.53 
 
 
988 aa  134  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  21.27 
 
 
990 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  21.33 
 
 
989 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  21.08 
 
 
988 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  21.27 
 
 
990 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  20.91 
 
 
988 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  21.29 
 
 
994 aa  131  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
990 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
990 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
990 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  21.28 
 
 
990 aa  130  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  20.36 
 
 
988 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.38 
 
 
990 aa  129  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.87 
 
 
989 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  42.67 
 
 
156 aa  125  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 
996 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  23.58 
 
 
988 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  23.58 
 
 
988 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  23.58 
 
 
988 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.34 
 
 
988 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.34 
 
 
988 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  42 
 
 
156 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  20.96 
 
 
988 aa  121  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  25.33 
 
 
573 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  23.47 
 
 
983 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  19.95 
 
 
997 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  20.93 
 
 
1015 aa  119  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  20.9 
 
 
964 aa  118  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.13 
 
 
988 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.99 
 
 
988 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.54 
 
 
988 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  22.71 
 
 
988 aa  115  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  22.71 
 
 
988 aa  115  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  20.89 
 
 
988 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  22.76 
 
 
988 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
550 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  23.52 
 
 
1006 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  23.52 
 
 
1006 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  22.89 
 
 
606 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  20.1 
 
 
989 aa  112  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  20.94 
 
 
985 aa  111  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  23.47 
 
 
992 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.19 
 
 
990 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 
996 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 
996 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 
996 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.37 
 
 
976 aa  109  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  30.37 
 
 
924 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.79 
 
 
961 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  22.14 
 
 
991 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  22.14 
 
 
991 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  24.82 
 
 
772 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 
994 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  22.43 
 
 
1029 aa  107  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  22.16 
 
 
771 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  24.57 
 
 
546 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  23.95 
 
 
435 aa  105  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  21.41 
 
 
1006 aa  104  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  21.6 
 
 
987 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.65 
 
 
755 aa  101  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  23.72 
 
 
1028 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  22.2 
 
 
993 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  22.2 
 
 
993 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  22.05 
 
 
986 aa  94.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  21.41 
 
 
969 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>