165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3479 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 992 aa  328  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  96.79 
 
 		 156 aa  314  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  65.36 
 
 		 1006 aa  213  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  51.37 
 
 		 267 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  48.05 
 
 		 1018 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  46.98 
 
 		 1028 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  46.98 
 
 		 1026 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  46.98 
 
 		 1026 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  46.31 
 
 		 1028 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  46.1 
 
 		 929 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  41.83 
 
 		 1015 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  45.21 
 
 		 188 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  41.33 
 
 		 1009 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  41.33 
 
 		 1009 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  41.33 
 
 		 1009 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  41.33 
 
 		 1009 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  42.67 
 
 		 1010 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  42.67 
 
 		 1010 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  42.66 
 
 		 1008 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4638  transposase  46.6 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.655234 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1015 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.78 
 
 		 999 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  31.37 
 
 		 1019 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.17 
 
 		 991 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.17 
 
 		 991 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  34.65 
 
 		 979 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  29.17 
 
 		 1015 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  25.69 
 
 		 991 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30.07 
 
 		 988 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30.07 
 
 		 988 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30.07 
 
 		 988 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  27.45 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  29.37 
 
 		 994 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  29.37 
 
 		 550 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  29.37 
 
 		 994 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  29.37 
 
 		 862 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  30.88 
 
 		 961 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  30.88 
 
 		 546 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.14 
 
 		 983 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  31.91 
 
 		 1020 aa  70.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  36.52 
 
 		 978 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  26.49 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 988 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  27.27 
 
 		 988 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  27.27 
 
 		 988 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  30.87 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  27.27 
 
 		 988 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 988 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  28.78 
 
 		 983 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  30.07 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.27 
 
 		 755 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 990 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 990 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 990 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 990 aa  67.8  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  33.61 
 
 		 928 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  32.64 
 
 		 435 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  30.97 
 
 		 246 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  26.9 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 990 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26.9 
 
 		 988 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  26.9 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26.9 
 
 		 988 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 		 970 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  26.9 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  30.97 
 
 		 338 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.9 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.2 
 
 		 987 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.9 
 
 		 988 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  27.97 
 
 		 994 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 		 1027 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.9 
 
 		 988 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  26.06 
 
 		 988 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.06 
 
 		 988 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  25.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.57 
 
 		 990 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  25.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  25.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  25.87 
 
 		 988 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 		 964 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  29.37 
 
 		 946 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  29.37 
 
 		 946 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.57 
 
 		 990 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  28.37 
 
 		 573 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.78 
 
 		 992 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  25.87 
 
 		 989 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 		 988 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  29.37 
 
 		 969 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  29.37 
 
 		 969 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  29.37 
 
 		 969 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.78 
 
 		 992 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  26.57 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  27.27 
 
 		 989 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  26.57 
 
 		 339 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  32.56 
 
 		 980 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  26 
 
 		 332 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  28.15 
 
 		 305 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  28.67 
 
 		 996 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>