178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0358 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 273 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  83.46 
 
 		 994 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  81.58 
 
 		 994 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  81.58 
 
 		 550 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  81.58 
 
 		 994 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  81.58 
 
 		 862 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  66.29 
 
 		 1015 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  65.41 
 
 		 988 aa  360  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  65.41 
 
 		 988 aa  360  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  65.04 
 
 		 988 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  65.04 
 
 		 988 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  65.04 
 
 		 988 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  65.04 
 
 		 988 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  65.04 
 
 		 989 aa  358  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  65.04 
 
 		 988 aa  357  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  65.41 
 
 		 988 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  64.29 
 
 		 988 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  63.91 
 
 		 964 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  63.53 
 
 		 988 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  63.53 
 
 		 988 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  63.67 
 
 		 755 aa  351  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  63.16 
 
 		 989 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  63.67 
 
 		 990 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 990 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  61.28 
 
 		 985 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  61.28 
 
 		 988 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  61.28 
 
 		 988 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  61.28 
 
 		 988 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  61.65 
 
 		 988 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  61.65 
 
 		 988 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  61.65 
 
 		 988 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  61.65 
 
 		 988 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  61.65 
 
 		 606 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  49.06 
 
 		 992 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  48.16 
 
 		 996 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  47.43 
 
 		 996 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  47.43 
 
 		 996 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  47.43 
 
 		 996 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  45.8 
 
 		 988 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  45.93 
 
 		 988 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  45.56 
 
 		 988 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  44.16 
 
 		 983 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  43.91 
 
 		 987 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  44.91 
 
 		 877 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  42.21 
 
 		 546 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  42.21 
 
 		 961 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  57.14 
 
 		 731 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  45.6 
 
 		 992 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  45.6 
 
 		 992 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  41.48 
 
 		 573 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  41.86 
 
 		 772 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  42.59 
 
 		 983 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.4 
 
 		 999 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  36.88 
 
 		 991 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  37.26 
 
 		 991 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  37.26 
 
 		 991 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  48.85 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  80.43 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  55 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  35.98 
 
 		 968 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  39.43 
 
 		 976 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  39.43 
 
 		 924 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  77.11 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  34.92 
 
 		 1006 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.87 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  33.83 
 
 		 1029 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.43 
 
 		 771 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  33.62 
 
 		 997 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  31.84 
 
 		 916 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  31.95 
 
 		 1028 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  37.67 
 
 		 613 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  37.67 
 
 		 738 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  29.03 
 
 		 986 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  28.89 
 
 		 990 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  31.49 
 
 		 1075 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  30.28 
 
 		 1019 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  30.68 
 
 		 929 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 		 1007 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 		 1007 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  82.69 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  29.55 
 
 		 1018 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.34 
 
 		 991 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.34 
 
 		 991 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 1028 aa  92.8  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  28.32 
 
 		 994 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 1028 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 1026 aa  92  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 1026 aa  92  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  29.74 
 
 		 1004 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  29.74 
 
 		 1004 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  29.32 
 
 		 1004 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.15 
 
 		 989 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  29.86 
 
 		 1019 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  30.17 
 
 		 1059 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  29.31 
 
 		 999 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>