137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4148 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  100 
 
 		 365 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  94.31 
 
 		 815 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  68.06 
 
 		 1009 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  54.29 
 
 		 974 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  52.86 
 
 		 874 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  52.38 
 
 		 969 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  49.76 
 
 		 988 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  46.89 
 
 		 969 aa  212  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  49.76 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  50.24 
 
 		 950 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  60.8 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  28.45 
 
 		 986 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  29.41 
 
 		 990 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  30.99 
 
 		 1004 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 		 1007 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  31.4 
 
 		 1007 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  29.41 
 
 		 1012 aa  96.3  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  30.99 
 
 		 1004 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  30.99 
 
 		 1004 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  30.18 
 
 		 1013 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  30.41 
 
 		 999 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  30.41 
 
 		 999 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  30.41 
 
 		 999 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  30.41 
 
 		 999 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  30.46 
 
 		 1059 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  30.68 
 
 		 995 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  30 
 
 		 994 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  29.41 
 
 		 995 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  29.41 
 
 		 989 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  28.24 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  28.24 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  30.18 
 
 		 990 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  28.32 
 
 		 1028 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  31.82 
 
 		 1006 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  31.82 
 
 		 1006 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  26.71 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  27.93 
 
 		 988 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 988 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 988 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 994 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 994 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.33 
 
 		 983 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.68 
 
 		 862 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.49 
 
 		 772 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  27.05 
 
 		 968 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  27.12 
 
 		 994 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  25.88 
 
 		 961 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.64 
 
 		 1006 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  25.88 
 
 		 546 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  25.71 
 
 		 987 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.99 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.99 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.99 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  26.54 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.29 
 
 		 755 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.54 
 
 		 924 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.65 
 
 		 992 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 		 988 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.86 
 
 		 989 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.71 
 
 		 991 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.71 
 
 		 991 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 990 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  25.83 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.71 
 
 		 990 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  34.78 
 
 		 992 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.71 
 
 		 990 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  30.16 
 
 		 972 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  34.78 
 
 		 992 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.86 
 
 		 988 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 		 964 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.31 
 
 		 988 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  29.1 
 
 		 977 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  29.1 
 
 		 977 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 988 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 991 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.31 
 
 		 988 aa  53.1  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  24.4 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.53 
 
 		 988 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.53 
 
 		 988 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  24.31 
 
 		 989 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  40.58 
 
 		 659 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.48 
 
 		 999 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.12 
 
 		 1015 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  26.26 
 
 		 928 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  26.7 
 
 		 978 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  27.23 
 
 		 980 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.32 
 
 		 573 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  31.58 
 
 		 979 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  33.02 
 
 		 946 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  33.02 
 
 		 969 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  33.02 
 
 		 969 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  33.02 
 
 		 969 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  33.02 
 
 		 946 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  31.53 
 
 		 979 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>