More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2043 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 410 aa  844    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  54.81 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  52.99 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  53.14 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  52 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  51.75 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  51.75 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  51.75 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  52.74 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  52.23 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  51.69 
 
 		 413 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  48.96 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  48.13 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  51.13 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  49.24 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  49.24 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  49.24 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  49.24 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  49.21 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  49.21 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  46.88 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  42.23 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  39.51 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  44.82 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  41.67 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  39.6 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  38.68 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  39.63 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  40.34 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  42.35 
 
 		 410 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  41.8 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  39.47 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.19 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  42.93 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.61 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  40.78 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  38.35 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  38.44 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  39.89 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  39.72 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  38.94 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  40.28 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  37.18 
 
 		 753 aa  183  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.23 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.46 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.43 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.32 
 
 		 352 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1733  hypothetical protein  47.78 
 
 		 116 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000606559  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  23.85 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.87 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  25.43 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  28.09 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  23.83 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  28.64 
 
 		 505 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  25.22 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.99 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  24.57 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  25.34 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  25 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  28.16 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  28.11 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  28.87 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  27.08 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  28.12 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  35.85 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  27.5 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  28.48 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0778  threonine dehydratase  27.27 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0589  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.44 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83915  threonine deaminase  25.41 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370739  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  28.48 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  24.4 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  25 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  25 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  27.78 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  31.49 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  27.38 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  27.41 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  25 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  25.71 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.73 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  22.29 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  26.09 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  32.08 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1623  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.59 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  32.08 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  25.08 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  22.29 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.81 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>