More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1070 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  99.01 
 
 		 404 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 404 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  99.26 
 
 		 404 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  98.51 
 
 		 404 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  51.74 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  52.13 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  52.74 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  52.74 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  51.39 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  51.75 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  52.42 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  51.36 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  50.13 
 
 		 410 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  49.6 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  49.36 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  49.36 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  47.85 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  44.09 
 
 		 410 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  43.24 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  39.23 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  41.58 
 
 		 410 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  38.27 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  38.29 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  37.99 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  37.37 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.14 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  35.19 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  38.2 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  36.7 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  35.6 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  36.16 
 
 		 403 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.34 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  36.03 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  38.75 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  37.07 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  38.52 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  40.06 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  40.06 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  35.92 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  39.23 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  39.5 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  34.88 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  34.88 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  34.8 
 
 		 753 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.93 
 
 		 352 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.87 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.06 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.48 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  27.94 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1733  hypothetical protein  50.57 
 
 		 116 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000606559  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  28.4 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  28.4 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  28.4 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  27.33 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  28.43 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  27.22 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.15 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25.72 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  25.25 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  26.42 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.62 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  25.4 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  27.33 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  29.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  27.01 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  27.01 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  25 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  29.3 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  26.37 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  26.37 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  29.73 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  29.95 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  24.46 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  28.22 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  25.59 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.12 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  28.45 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  24.77 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  24.52 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  24.52 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  30.91 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  27.62 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  27.12 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  27.12 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  25 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>