More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1828 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 345 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.59 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  38.21 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  39.7 
 
 		 403 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  39.17 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  38.84 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  38.24 
 
 		 396 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  36.56 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  36.94 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  38.28 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  40.88 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  39.65 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  39.35 
 
 		 407 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  39.05 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  38.2 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  31.79 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  35.5 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  38.2 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  29.19 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  30.57 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  29.2 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  30.88 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  30.88 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  30.88 
 
 		 404 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  30.88 
 
 		 404 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  30 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  31.14 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  31.14 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  31.14 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  31.14 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  30.29 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  31.44 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  31.44 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  31.44 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  31.44 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  30.79 
 
 		 408 aa  135  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  30.03 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  31.4 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  39.41 
 
 		 410 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  39.41 
 
 		 410 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  38.82 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  29.27 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  28.77 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.52 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  38.03 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  29.71 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  33.43 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  28.36 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  33.43 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  30.24 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  31.48 
 
 		 753 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.85 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.83 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  37.1 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  29.68 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.04 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.56 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  30.53 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  31.72 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.99 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.99 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  28.32 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  33.64 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  28.08 
 
 		 501 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  27.49 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  26.95 
 
 		 511 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  32.04 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  26.95 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  31.8 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  31.33 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  28.9 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  34.87 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  34.56 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  31.34 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  28.09 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  29.74 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  30.27 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  31.92 
 
 		 505 aa  72.8  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  29.74 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  30.09 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  28.87 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  31.05 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  32.32 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  34.76 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  29.63 
 
 		 501 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  29.11 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  29.81 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  30.14 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  33.48 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  31.86 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  29.41 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  31.51 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  27.03 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  27.03 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>