262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1422 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 393 aa  811    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  47.3 
 
 		 400 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  47.14 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  46.88 
 
 		 405 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  44.59 
 
 		 400 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  46.87 
 
 		 413 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  45.53 
 
 		 406 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  44.74 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  43.4 
 
 		 404 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  43.13 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  43.24 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  42.97 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  43.33 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  40.51 
 
 		 408 aa  299  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  42.23 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  42.62 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  42.62 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  42.32 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  42.05 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  39.78 
 
 		 390 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  37.16 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  36.53 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  36.96 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  36.78 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  36.52 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  34.98 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  35.77 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  36.39 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  35.08 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  35 
 
 		 407 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  34.9 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  37.43 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  37.12 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.33 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  34.07 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  32.87 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  33.78 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  33.24 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  33.96 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  33.33 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  33.06 
 
 		 414 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  31.74 
 
 		 753 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  33.97 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  33.97 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  33.43 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  33.42 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.77 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.12 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.19 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.1 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  27.96 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1733  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000606559  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  35.06 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  31.22 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  30.61 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  31.07 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  25.29 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02390  serine family amino acid catabolism-related protein, putative  25.64 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  32.03 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  26.85 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  30.91 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  30.38 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  32.72 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  30.3 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  32.72 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  25.74 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  23.47 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  29.93 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  29.25 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  29.25 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  30 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  27.66 
 
 		 502 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  25 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  28.48 
 
 		 513 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  31.78 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  32.41 
 
 		 516 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  28.92 
 
 		 505 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  23.2 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  22.89 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  27.03 
 
 		 527 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  24.42 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  25 
 
 		 451 aa  53.1  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  28.23 
 
 		 507 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  28.97 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  27.47 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  27.47 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>