124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2250 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  100 
 
 		 451 aa  903    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  98.67 
 
 		 451 aa  893    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  78.07 
 
 		 379 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  60.83 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  58.14 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  56.68 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  50.68 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  48.45 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  56.38 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  49.06 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  46.62 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  46.4 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  49.43 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  50.8 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  46.9 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  46.4 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  45.29 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  45.52 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  45.96 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  45.52 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  56.09 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  56.09 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  45.52 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  46.67 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  54.94 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  46.95 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  46.26 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  50.8 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  50.8 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  50.35 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  48.36 
 
 		 451 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  48.07 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  46.14 
 
 		 432 aa  354  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  50.24 
 
 		 461 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  48.14 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  49.22 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  46.59 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  46.48 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  46.59 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  46.59 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  46.59 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  46.59 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  46.35 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  46.35 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  41.51 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  45 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  44.52 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  47.94 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  44.66 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  45.75 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  47.38 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  43.67 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  48.55 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  37.36 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  59.57 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  59.57 
 
 		 282 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  46.4 
 
 		 155 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  46.4 
 
 		 155 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  28.83 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  29.37 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  39.53 
 
 		 110 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  29.25 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2425  hypothetical protein  61.02 
 
 		 105 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  26.77 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  26.48 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  25 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  27.96 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  25.83 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  25.93 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  25.93 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  27.4 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  28.02 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  29.05 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  24.57 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1537  threonine synthase  28.21 
 
 		 325 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  24.32 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  25.08 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25.08 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  28.15 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  27.51 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  26.51 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.81 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  24.39 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  22.88 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  22.92 
 
 		 753 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  21.4 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  23.12 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  26.88 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  26.09 
 
 		 505 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  26.71 
 
 		 316 aa  47.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  26.86 
 
 		 514 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  24.77 
 
 		 504 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  25.23 
 
 		 321 aa  46.6  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  22.65 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  22.38 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>