148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS1653 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  95.26 
 
 
443 aa  847    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  100 
 
 
446 aa  915    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  96.86 
 
 
446 aa  870    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  97.09 
 
 
446 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  100 
 
 
446 aa  915    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  89.84 
 
 
443 aa  803    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  100 
 
 
464 aa  915    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  90.07 
 
 
443 aa  807    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  95.26 
 
 
443 aa  848    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  92.78 
 
 
445 aa  818    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  69.04 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  66.97 
 
 
459 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  63.22 
 
 
441 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  62.56 
 
 
442 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  62.56 
 
 
442 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  62.56 
 
 
442 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
442 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  63.19 
 
 
443 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  62.56 
 
 
442 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  62.56 
 
 
442 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  62.56 
 
 
442 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  62.56 
 
 
438 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  61.98 
 
 
443 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  61.14 
 
 
440 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  61.57 
 
 
443 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  61.14 
 
 
440 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
440 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  61.14 
 
 
440 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
440 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  62.53 
 
 
441 aa  534  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  62.36 
 
 
449 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  58.73 
 
 
449 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  59.18 
 
 
445 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  61.08 
 
 
461 aa  518  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  58.03 
 
 
445 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  65.66 
 
 
422 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  57.47 
 
 
451 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  61.21 
 
 
432 aa  514  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  60.78 
 
 
434 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  60.74 
 
 
445 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  58.99 
 
 
448 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  60.86 
 
 
446 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  58.99 
 
 
448 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  54.4 
 
 
456 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  58.88 
 
 
438 aa  490  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  48.27 
 
 
440 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  51.56 
 
 
455 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  47.58 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  44.47 
 
 
442 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  45.88 
 
 
446 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  45.96 
 
 
451 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  46.92 
 
 
473 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  45.52 
 
 
451 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  48.13 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  43.29 
 
 
444 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  44.74 
 
 
445 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  44.5 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  44.74 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  44.44 
 
 
429 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  51.12 
 
 
282 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  51.12 
 
 
283 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  55.32 
 
 
110 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  35.2 
 
 
155 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  35.2 
 
 
155 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  24.47 
 
 
520 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  22.83 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2835  D-serine dehydratase (D-serine deaminase) (DSD)  69.44 
 
 
46 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  hitchhiker  0.00000000706705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  22.3 
 
 
405 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  21.73 
 
 
415 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  25.84 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  25.76 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  22.71 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.86 
 
 
319 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.68 
 
 
319 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  25.19 
 
 
290 aa  53.5  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  22.42 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  24.74 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.3 
 
 
315 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  20.77 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  23.15 
 
 
321 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  22.42 
 
 
505 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  21.41 
 
 
402 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  24.14 
 
 
530 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.43 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  23.82 
 
 
519 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.17 
 
 
318 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  22.52 
 
 
291 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  22.36 
 
 
514 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  24.2 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  25.82 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  23.32 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  23.14 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  25.55 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  24.14 
 
 
519 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  23.86 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>