139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  100 
 
 		 448 aa  896    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  97.77 
 
 		 448 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  76.29 
 
 		 446 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  67.04 
 
 		 449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  67.49 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  65.75 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  64.52 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  62.1 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  64.52 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  64.37 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  64.52 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  64.52 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  65.06 
 
 		 441 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  64.37 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  64.29 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  64.29 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  64.29 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  63.8 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  63.49 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  63.66 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 440 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  62.56 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  64.83 
 
 		 445 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  64.18 
 
 		 422 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  62.16 
 
 		 434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  59.77 
 
 		 443 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  59.31 
 
 		 443 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  59.45 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  58.62 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  58.99 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  58.99 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  58.99 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  58.99 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  58.99 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  58.89 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  55.99 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  57.69 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  61.5 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  55.96 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  56.02 
 
 		 449 aa  461  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  50.96 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  52.85 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  48.95 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  46.54 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  49.65 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  50 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  50.8 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  50.8 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  53.05 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  45.39 
 
 		 473 aa  353  4e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  50.23 
 
 		 444 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  50.12 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  49.88 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  49.88 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  49.65 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  51.77 
 
 		 282 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  51.41 
 
 		 283 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  53.49 
 
 		 110 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  46.88 
 
 		 155 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  46.88 
 
 		 155 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  24.49 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  25.62 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  26.3 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  27.97 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  23.94 
 
 		 290 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  25.47 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  24.91 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  25.42 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  25.32 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.21 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  25 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  25 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  25.32 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  25 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  25.79 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  25.43 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  23.43 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  25.93 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.26 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  22.68 
 
 		 753 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  25.42 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  25.23 
 
 		 507 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  26.63 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  26.48 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  26.14 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  26.61 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  23.51 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  22.3 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  25.73 
 
 		 503 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1623  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.57 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  22.06 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2835  D-serine dehydratase (D-serine deaminase) (DSD)  55.56 
 
 		 46 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  hitchhiker  0.00000000706705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.97 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0379414  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  24.61 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  26.53 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  25.74 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>