61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1576 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  90.97 
 
 		 445 aa  244  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  90.32 
 
 		 445 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  90.32 
 
 		 445 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  85.07 
 
 		 444 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  61.72 
 
 		 446 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  58.02 
 
 		 443 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  45.86 
 
 		 448 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  36.72 
 
 		 473 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  45.11 
 
 		 448 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  45.8 
 
 		 455 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  50.4 
 
 		 451 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  50.4 
 
 		 451 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  44.8 
 
 		 449 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  36.69 
 
 		 464 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  36 
 
 		 443 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  36 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  36 
 
 		 446 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  36 
 
 		 446 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  35.37 
 
 		 449 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  36 
 
 		 443 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  35.2 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  40.46 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  35.2 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  35.2 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  35.2 
 
 		 443 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  42.4 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  44.62 
 
 		 456 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  34.4 
 
 		 445 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  41.13 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  39.2 
 
 		 461 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  38.03 
 
 		 451 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  49.14 
 
 		 429 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  38.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  39.2 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  39.2 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  41.88 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  36.07 
 
 		 438 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  39.84 
 
 		 441 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  36.22 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  40.95 
 
 		 422 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  32.81 
 
 		 432 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  33.07 
 
 		 441 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  38.46 
 
 		 434 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  34.4 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  35.96 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  43.1 
 
 		 446 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  35.66 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  30.33 
 
 		 443 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>