114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4659 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  71.82 
 
 		 442 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  71.59 
 
 		 442 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  100 
 
 		 443 aa  912    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  75.34 
 
 		 443 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  77.17 
 
 		 441 aa  683    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  75.79 
 
 		 443 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  71.82 
 
 		 442 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  71.82 
 
 		 442 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  74.03 
 
 		 441 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  71.59 
 
 		 442 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  72.64 
 
 		 438 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  71.82 
 
 		 442 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  71.17 
 
 		 440 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  71.17 
 
 		 440 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  71.17 
 
 		 440 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  71.4 
 
 		 440 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  71.17 
 
 		 440 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  72.05 
 
 		 442 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  69.84 
 
 		 445 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  71.36 
 
 		 432 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  71.14 
 
 		 434 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  71.91 
 
 		 422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  62.1 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  62.07 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  62.07 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  62.07 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  61.15 
 
 		 443 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  61.57 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  61.57 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  61.86 
 
 		 449 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  62.09 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  62.39 
 
 		 446 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  61.7 
 
 		 445 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  61.57 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  60.88 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  61.34 
 
 		 446 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  57.93 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  61.65 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  59.82 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  57.05 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  57.01 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  55 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  57.11 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  57.04 
 
 		 461 aa  474  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  55.14 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  43.39 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  45.2 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  42.46 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  46.06 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  43.06 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  45.5 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  44.77 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  43.93 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  44.17 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  41.15 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  42.27 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  41.1 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  41.1 
 
 		 445 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  40.84 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  46.07 
 
 		 282 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  46.07 
 
 		 283 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  47.06 
 
 		 110 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  23.33 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  21.41 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  21.85 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.96 
 
 		 318 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  23.64 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  24.54 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  26.61 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  26.15 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  24.53 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  26.29 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.82 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  24.65 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  23.74 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  25.94 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  21.25 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  25.94 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  25.35 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  21.57 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  25.56 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  23.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  25.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  23.66 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  22.71 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  26.04 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  23.4 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  24.88 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  24.71 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  24.81 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  24.87 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  21.98 
 
 		 503 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  28.26 
 
 		 305 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  22.77 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  20.51 
 
 		 753 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  21.15 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  22.75 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  23.81 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  21.85 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  34.72 
 
 		 155 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>