83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2515 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  71.72 
 
 		 442 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  71.36 
 
 		 441 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  71.95 
 
 		 442 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  71.88 
 
 		 443 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  71.95 
 
 		 442 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  71.95 
 
 		 442 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  100 
 
 		 445 aa  909    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  72.77 
 
 		 441 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  71.72 
 
 		 442 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  72.31 
 
 		 438 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  72.17 
 
 		 442 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  69.84 
 
 		 443 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  71.95 
 
 		 442 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  71.2 
 
 		 443 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  71 
 
 		 440 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  70.78 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  70.78 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  71 
 
 		 440 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  70.78 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  72.85 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  72.29 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  67.75 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  65.51 
 
 		 449 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  64.83 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  63.66 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  64.75 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  60.77 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  61.4 
 
 		 451 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  61.43 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  60.74 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  61.52 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  60.74 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  60.74 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  67.65 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  61.52 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  61.2 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  58.37 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  60.05 
 
 		 446 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  60.05 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  60.8 
 
 		 443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  58.62 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  61.11 
 
 		 461 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  56.36 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  58.11 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  50.7 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  49.53 
 
 		 455 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  47.43 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  44.78 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  45.52 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  46.01 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  44.5 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  50.94 
 
 		 379 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  47.59 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  47.59 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  45.35 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  47.14 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  45.96 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  45.96 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  45.73 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  50.18 
 
 		 283 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  50.18 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  49.4 
 
 		 110 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  41.6 
 
 		 155 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  41.6 
 
 		 155 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  23.73 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  24.16 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  25.31 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  23.26 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  24.07 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  24.44 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.16 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  23.36 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  24.68 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  23.46 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  21.67 
 
 		 343 aa  47  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  24.44 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  23.43 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  33.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  23.83 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  23.44 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  26.28 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  22.76 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>