102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0362 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  73.29 
 
 		 442 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  73.06 
 
 		 442 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  77.17 
 
 		 443 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  100 
 
 		 441 aa  910    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  79 
 
 		 443 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  73.29 
 
 		 442 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  73.29 
 
 		 442 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  73.56 
 
 		 441 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  73.06 
 
 		 442 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  73.21 
 
 		 438 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  71.89 
 
 		 440 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  73.52 
 
 		 442 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  73.29 
 
 		 442 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  76.14 
 
 		 443 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  71.66 
 
 		 440 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  71.66 
 
 		 440 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  71.66 
 
 		 440 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  71.66 
 
 		 440 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  71.36 
 
 		 445 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  71.43 
 
 		 432 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  73.24 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  71 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  63.45 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  63.59 
 
 		 449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  64.83 
 
 		 445 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  63.22 
 
 		 446 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  63.22 
 
 		 446 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  63.22 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  62.53 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  62.99 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  63.45 
 
 		 443 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  63.59 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  62.99 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  61.34 
 
 		 451 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  63.49 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  63.02 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  64.52 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  60.24 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  59.73 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  58.9 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  61.59 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  57.37 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  54.98 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  57.51 
 
 		 438 aa  474  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  45.81 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  47.52 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  45.02 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  46.51 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  43.82 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  49.38 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  48.07 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  46.31 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  48.64 
 
 		 379 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  42.56 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  47.34 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  44.27 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  44.27 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  44 
 
 		 445 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  48.35 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  48.35 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  45.78 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  25.95 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  28.11 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  24.41 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  25.19 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  21.28 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  25.23 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  24.1 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.23 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  23.58 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  24.31 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  22.5 
 
 		 753 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  22.95 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  37.66 
 
 		 155 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  37.66 
 
 		 155 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.58 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  22.36 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  24.44 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  21.51 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  25.94 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  22.18 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  20.69 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  21.92 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  23.27 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  21.2 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28 
 
 		 322 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  20.3 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  25.47 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  23.58 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  23.39 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  21 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  25.33 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  22.75 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0647  L-threonine ammonia-lyase  25.79 
 
 		 330 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  20.77 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  22.45 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  23.27 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  21.07 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  20.39 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>