101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1577 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  99.65 
 
 		 445 aa  557  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  100 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  100 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  92.2 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  69.68 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  69.18 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  62.28 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  62.54 
 
 		 455 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  59.57 
 
 		 451 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  59.22 
 
 		 451 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  52.65 
 
 		 442 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 440 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  55.56 
 
 		 449 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  47.52 
 
 		 445 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  51.58 
 
 		 456 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  51.09 
 
 		 451 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  51.12 
 
 		 446 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  51.12 
 
 		 446 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  51.12 
 
 		 446 aa  255  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  51.12 
 
 		 446 aa  255  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  51.12 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 440 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 440 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 440 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  52.04 
 
 		 459 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  50.89 
 
 		 440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  50.37 
 
 		 443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 443 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  50.89 
 
 		 440 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 443 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 443 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  49.82 
 
 		 442 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  49.82 
 
 		 442 aa  251  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  49.82 
 
 		 442 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  49.82 
 
 		 442 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 464 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  49.47 
 
 		 442 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  49.47 
 
 		 442 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  49.29 
 
 		 438 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  49.47 
 
 		 442 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  50.37 
 
 		 445 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  50.35 
 
 		 445 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  49.28 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  51.6 
 
 		 446 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  50.71 
 
 		 449 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  50.18 
 
 		 445 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  49.47 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  52.36 
 
 		 461 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  51.77 
 
 		 448 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  49.07 
 
 		 441 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  47.21 
 
 		 443 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  46.35 
 
 		 438 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  51.77 
 
 		 448 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  47.33 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  45.49 
 
 		 443 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  46.07 
 
 		 443 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  47.1 
 
 		 441 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  41.58 
 
 		 473 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  54.65 
 
 		 429 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  40.24 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  28.77 
 
 		 415 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  29.91 
 
 		 401 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  23.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  23.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  23.44 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  26.64 
 
 		 506 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  26.64 
 
 		 506 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  23.44 
 
 		 404 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.49 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  27.57 
 
 		 403 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  25.12 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  30.19 
 
 		 414 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  24.73 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  27.1 
 
 		 403 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  28.21 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  27.59 
 
 		 509 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  24.36 
 
 		 753 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  28.21 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  26.64 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13987  predicted protein  27.1 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  27.14 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  26.67 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  25 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  24.38 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  28.7 
 
 		 520 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  23.92 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1147  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.29 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0356763  normal  0.422182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  27.56 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  28.94 
 
 		 501 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  27.56 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  25.6 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>