113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1718 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  100 
 
 		 432 aa  894    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  71.36 
 
 		 443 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  71.43 
 
 		 441 aa  618  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  71 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  71 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  71 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  71 
 
 		 438 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  71.23 
 
 		 442 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  71 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  70.77 
 
 		 442 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  70.77 
 
 		 442 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  69.48 
 
 		 443 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  70.82 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  70.73 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  69 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  69 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  69 
 
 		 440 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  69 
 
 		 440 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  69 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  67.75 
 
 		 445 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  70.84 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  68.84 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  62.56 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  61.86 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  62.18 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  62.38 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  62.62 
 
 		 443 aa  521  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  62.15 
 
 		 443 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  62 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  60.61 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  61.31 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  62.24 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  61.21 
 
 		 446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  61.54 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  61.21 
 
 		 446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  61.21 
 
 		 464 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  58.77 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  59.76 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  58.74 
 
 		 456 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  60.71 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  56.28 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  59.95 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  56.98 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  57.51 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  54.1 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  44.63 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  48.35 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  46.03 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  45.63 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  42.4 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  44.55 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  46.44 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  46.44 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  47.99 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  42.19 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  45.91 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  43.8 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  43.54 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  43.8 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  47.33 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  47.33 
 
 		 282 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  45.88 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  23.83 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  23.59 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  24.06 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.39 
 
 		 318 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  22.34 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  23.84 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  22.56 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  24.17 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  23.56 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0413  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.5 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  21.65 
 
 		 753 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  23.13 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  23.62 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  30.21 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  25.58 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 155 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  39.73 
 
 		 155 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  24.72 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  26.29 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  22.61 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  23.85 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  22.02 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  21.46 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  22.99 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2425  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  22.83 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.82 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1735  tryptophan synthase subunit beta  21.84 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.38 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  22.35 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  21.91 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  21.1 
 
 		 606 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  24.88 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0309  L-threonine ammonia-lyase  26.29 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  23.73 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.21 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  21.26 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3966  threonine dehydratase  23.03 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>