140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2856 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  99.55 
 
 		 445 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  88.66 
 
 		 444 aa  725    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  99.55 
 
 		 445 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  100 
 
 		 445 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  99.65 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  66.67 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  64.38 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  56.84 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  59.3 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  56.32 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  56.09 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  48.37 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  47.86 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  45.82 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  44.98 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  44.98 
 
 		 446 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  44.26 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  44.74 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  44.74 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  44.74 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  44.74 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  44.74 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  49.88 
 
 		 448 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  47.96 
 
 		 456 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  48.15 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  44.5 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  45.58 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  43.1 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  44.6 
 
 		 464 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  44.02 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  46.99 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  49.42 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  45.01 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  45.01 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  45.01 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  45.01 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  44.78 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  44.78 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  44.55 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  44.44 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  45.03 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  45.03 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  45.03 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  44.8 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  44.44 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  44.8 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  45.7 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  41.97 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  45.96 
 
 		 445 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  46.12 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  38.43 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  44.16 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  41.26 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  42.12 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  41.24 
 
 		 432 aa  305  7e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  46.91 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  42.08 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  42.66 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  39.12 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  51.46 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  98.54 
 
 		 155 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  98.54 
 
 		 155 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  29.93 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  23.69 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  40.51 
 
 		 110 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  25.27 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  29.92 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  24.7 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  29.41 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  26.49 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  26.49 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  27.36 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  23.11 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1147  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.26 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0356763  normal  0.422182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  23.11 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  25.58 
 
 		 753 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  27.38 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  26.81 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  23.9 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  29.23 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  26.35 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  23.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  22.67 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  25.99 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  24.26 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  22.67 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 504 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.64 
 
 		 333 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  23.08 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  23.71 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  25.27 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.3 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.6 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  26.15 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  30.06 
 
 		 550 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  25.26 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  24.77 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  27.19 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  24.77 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>