102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2017 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  100 
 
 		 464 aa  969    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  69.27 
 
 		 446 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  69.43 
 
 		 443 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  68.81 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  68.74 
 
 		 443 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  68.97 
 
 		 443 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  69.04 
 
 		 446 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  69.04 
 
 		 446 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  68.81 
 
 		 443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  69.04 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  69.04 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  64.03 
 
 		 459 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  58.9 
 
 		 449 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  62.21 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  59.73 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  61.21 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  59.27 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  62.03 
 
 		 438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  62.03 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  61.79 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  57.51 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  60.92 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  59.49 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  59.76 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  60.18 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  60.85 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  57.69 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  58.62 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  61.86 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  57.47 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  59.91 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  54.11 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  53.18 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  54.1 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  45.35 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.59 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  48.46 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  48.21 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  44.06 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  45.48 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  46.96 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  46.26 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  49.31 
 
 		 379 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.73 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  44.6 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  44.6 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  44.37 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  44.68 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 282 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  50.75 
 
 		 283 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  51.19 
 
 		 110 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  23.34 
 
 		 410 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  39.2 
 
 		 155 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  39.2 
 
 		 155 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  21.15 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  24.83 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2835  D-serine dehydratase (D-serine deaminase) (DSD)  60.47 
 
 		 46 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  hitchhiker  0.00000000706705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  20.98 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  23.43 
 
 		 291 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  23.41 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  23.05 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.61 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  24.32 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  29.79 
 
 		 305 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  23.9 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  20.87 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  22.05 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  23.98 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  22.76 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  22.83 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  22.59 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  21.39 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  21.57 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  24.37 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1958  tryptophan synthase subunit beta  24.57 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  22.71 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  29.11 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  23.56 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  22.51 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  21.26 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  22.82 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  22.51 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  22.51 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.45 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  20.59 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  20.59 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  26.9 
 
 		 771 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  21.95 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>