130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2895 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  100 
 
 		 449 aa  922    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  63.19 
 
 		 443 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  62.73 
 
 		 443 aa  538  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  62.82 
 
 		 445 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  62.04 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  62.36 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  61.66 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  62.36 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  62.36 
 
 		 446 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  61.66 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  61.43 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  61.21 
 
 		 464 aa  525  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  60.05 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  57.41 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  59.64 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  59.42 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  59.42 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  59.42 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  59.42 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  59.42 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  59.42 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  60.23 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  59.35 
 
 		 461 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  58.77 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  57.37 
 
 		 441 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  56.98 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  58.88 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  58.11 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  62.03 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  57.51 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  56.55 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  56.09 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  56.02 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  54.86 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  56.02 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  55.2 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  54.23 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  54.77 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  58.33 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  53.6 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  51.69 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  50.12 
 
 		 443 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  49.3 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  49.31 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  43.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  44.44 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  49.66 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  49.43 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  46.59 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  50 
 
 		 379 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  44.44 
 
 		 473 aa  350  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  45.82 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  45.6 
 
 		 445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  45.6 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  43.3 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  53.57 
 
 		 282 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  53.57 
 
 		 283 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  48.84 
 
 		 110 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  26.48 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.38 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  36.23 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  36.23 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  24.6 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  23.45 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2835  D-serine dehydratase (D-serine deaminase) (DSD)  60.47 
 
 		 46 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  hitchhiker  0.00000000706705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  24.53 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  26.62 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  21.75 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  23.1 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  25 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.02 
 
 		 318 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0037  hypothetical protein  25.68 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  23.11 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2674  hypothetical protein  26.54 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  23.24 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.29 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  23.03 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  25.12 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  24.51 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  21.21 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  23.85 
 
 		 315 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  23.37 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  25.76 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  24.82 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  22.75 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.98 
 
 		 301 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0327  tryptophan synthase subunit beta  19.62 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  23.02 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3022  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.05 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.380289  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  26.99 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.89 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  23.39 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0647  L-threonine ammonia-lyase  24.9 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  23.46 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>