More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0730 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  57.28 
 
 		 328 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  59.05 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  59.42 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  57.14 
 
 		 320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  56.96 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  58.79 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  58.58 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  56.15 
 
 		 339 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  59.45 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  56.55 
 
 		 316 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  54.84 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  57.19 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  56.65 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  56.33 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  54.31 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  51.42 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  56.33 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  47.91 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.98 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.28 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 400 aa  168  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.07 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  34.38 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  32.18 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.07 
 
 		 403 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  37.87 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  32.18 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.56 
 
 		 404 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  34.89 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  36.74 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  30.91 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  31.75 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.55 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  37.72 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.78 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 504 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.66 
 
 		 507 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.48 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.07 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 504 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.18 
 
 		 506 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  37.1 
 
 		 402 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.18 
 
 		 506 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 519 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  33.97 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.72 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.94 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  34.89 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  32.32 
 
 		 510 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.26 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  35.2 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  33.78 
 
 		 516 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  34.77 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  34.9 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  30.72 
 
 		 515 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  32.1 
 
 		 401 aa  135  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.54 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  34.22 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  34.22 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  33.79 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  34.46 
 
 		 516 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  36.86 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.35 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  35.24 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  34.49 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2525  hypothetical protein  37.03 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0335353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 509 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  31.31 
 
 		 515 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  35.85 
 
 		 412 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  34.43 
 
 		 504 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  31.67 
 
 		 511 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  34.94 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.13 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.94 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  34.91 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.26 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 519 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  36.86 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  33.55 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  31.15 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  31.63 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  31.46 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  35.08 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  35.02 
 
 		 416 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>