More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4911 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  60.5 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  60.58 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  59.94 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  60.65 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  59.55 
 
 		 333 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  57.78 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  55.23 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  57.65 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  60.87 
 
 		 334 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  60.63 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  60.63 
 
 		 324 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  60.9 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  55.84 
 
 		 330 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  57 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  52.9 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  55.31 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  53.05 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  50.97 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  46.3 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.93 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.11 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.53 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  32.48 
 
 		 403 aa  168  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  32.08 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  34.26 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.9 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  33.85 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  33.02 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  32.71 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  30.82 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  31.03 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.69 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  30.72 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  30.72 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  30.6 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.81 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.04 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  34.98 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  35.71 
 
 		 506 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  35.71 
 
 		 506 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  34.83 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  34.49 
 
 		 400 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  33.02 
 
 		 515 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  32 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  32.71 
 
 		 515 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  31.17 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  32.26 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.54 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  31.17 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  28.91 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  31.17 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  31.48 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  30.84 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  30.84 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  32.26 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  33.12 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.48 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  32.57 
 
 		 520 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0534  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.65 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 399 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  32.91 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  35.54 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  30.7 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  34.07 
 
 		 410 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  33.85 
 
 		 412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  32.09 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.16 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 514 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2619  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.6 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4347  serine/threonine dehydratase  32.4 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  31.42 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  31.42 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.27 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  33.01 
 
 		 516 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  33.87 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  33.02 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  31.42 
 
 		 514 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  33.22 
 
 		 519 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  31.97 
 
 		 403 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>