More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0066 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  100 
 
 		 358 aa  707    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  55.06 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  49.54 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  52.98 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  49.69 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  46.33 
 
 		 404 aa  285  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  53.63 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  53.63 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.69 
 
 		 402 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 402 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  52.2 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  48.24 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.4 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.4 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  48.1 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  47.19 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  47 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  50.96 
 
 		 402 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  50.89 
 
 		 407 aa  268  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  50.31 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  50 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  51.16 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  50.46 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  47.73 
 
 		 408 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  48.08 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  46.2 
 
 		 401 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  51.94 
 
 		 406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.74 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  50 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  46.5 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.5 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  43.99 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  47.19 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  46.04 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  51.69 
 
 		 410 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  47.98 
 
 		 412 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  42.77 
 
 		 403 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  47.73 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  44.62 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  48.54 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  51.6 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  50.16 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  45.91 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  47.77 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  47.77 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  48.29 
 
 		 412 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  52.58 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  47.45 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  47.77 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  47.45 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.03 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  51.61 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.37 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  49.05 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  47.48 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.14 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  46.87 
 
 		 443 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  47.26 
 
 		 421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  47.92 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  44.85 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  51.32 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  50 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  40.84 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  46.44 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.48 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  50.17 
 
 		 412 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  47.89 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  52.63 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.11 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  49.53 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  41.12 
 
 		 346 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  41.12 
 
 		 346 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.23 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  48.37 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.45 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.8 
 
 		 537 aa  226  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  41.57 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  44.41 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>