More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0945 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  100 
 
 		 418 aa  832    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  54.61 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  53.1 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  56.25 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  51.52 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  56.22 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  46.37 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  47.03 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  47.63 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  49.1 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  49.1 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  44.16 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  49.27 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  45.06 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  42.78 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  42.27 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  42.27 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  46.72 
 
 		 402 aa  305  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  44.51 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  41.99 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  41.54 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  46.24 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  45.88 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.65 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  46.51 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  47.4 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.54 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  47.01 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  46.8 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  45.33 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.31 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  43.15 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  48.88 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.09 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  40.98 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 537 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.73 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.68 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.76 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.73 
 
 		 413 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  42.97 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  42.08 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.38 
 
 		 343 aa  270  5e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  44.21 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.13 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  40.92 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  46.37 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.08 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.32 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  43.59 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.18 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  43.43 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  41.15 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.43 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  43.35 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  44.11 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  44.7 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  44.81 
 
 		 415 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  47.95 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  47.95 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.1 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  38.38 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  40.53 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  42.74 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  45.08 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  42.06 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  39.79 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.67 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.19 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.27 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  39.47 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.18 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  42.52 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.31 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.65 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  40.55 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  40.83 
 
 		 404 aa  236  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.6 
 
 		 402 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>