More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0103 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  100 
 
 
401 aa  803    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  65.73 
 
 
395 aa  521  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  54.14 
 
 
402 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  52.63 
 
 
402 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  55.08 
 
 
406 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  53.75 
 
 
403 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  49.75 
 
 
405 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.67 
 
 
403 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.16 
 
 
403 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  46.67 
 
 
403 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  47.24 
 
 
402 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  45.34 
 
 
403 aa  359  5e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  46.29 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  48.25 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  44.33 
 
 
403 aa  352  8.999999999999999e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.34 
 
 
403 aa  347  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  48.21 
 
 
403 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  48.21 
 
 
403 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  48.36 
 
 
401 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  48.21 
 
 
403 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  48.36 
 
 
401 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.23 
 
 
402 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  44.72 
 
 
403 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  45.84 
 
 
400 aa  335  7e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  44.61 
 
 
403 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  44.55 
 
 
403 aa  333  4e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.11 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.11 
 
 
402 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.04 
 
 
415 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  47.63 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.32 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.44 
 
 
408 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.46 
 
 
404 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.75 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  47.49 
 
 
402 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45 
 
 
413 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.23 
 
 
537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  44.53 
 
 
403 aa  308  8e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  46.48 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  45.02 
 
 
403 aa  305  7e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.54 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.65 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  41.85 
 
 
403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  43.8 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.67 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.45 
 
 
402 aa  301  9e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  44 
 
 
410 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  43.19 
 
 
402 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42.28 
 
 
403 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  41.28 
 
 
412 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.28 
 
 
404 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.54 
 
 
402 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  42.82 
 
 
404 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.94 
 
 
408 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.5 
 
 
399 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  41.29 
 
 
443 aa  294  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  41.85 
 
 
412 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.46 
 
 
406 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40.75 
 
 
400 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.6 
 
 
412 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.24 
 
 
410 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  41.98 
 
 
406 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  39.5 
 
 
400 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  43.3 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.15 
 
 
409 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  42.75 
 
 
410 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  44.19 
 
 
402 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  43.94 
 
 
402 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  43 
 
 
416 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  43.88 
 
 
504 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.71 
 
 
411 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  40.26 
 
 
511 aa  279  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.21 
 
 
403 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  43.88 
 
 
504 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.79 
 
 
332 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  41.21 
 
 
415 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  42.21 
 
 
402 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  39.9 
 
 
400 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  42 
 
 
411 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  44.03 
 
 
403 aa  275  9e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  39.23 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.29 
 
 
402 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  39.9 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  43.15 
 
 
501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  41.69 
 
 
399 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  41.69 
 
 
399 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  40.51 
 
 
403 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  41.22 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.45 
 
 
415 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  38.38 
 
 
415 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  42.18 
 
 
514 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.19 
 
 
506 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.19 
 
 
506 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  38.12 
 
 
414 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  41.43 
 
 
505 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  42.28 
 
 
413 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  37.47 
 
 
531 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  42.17 
 
 
509 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  40.41 
 
 
507 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  36.66 
 
 
411 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>