More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1237 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  100 
 
 
412 aa  819    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  93.93 
 
 
412 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  66.26 
 
 
443 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  55.87 
 
 
402 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  57.46 
 
 
402 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  55.89 
 
 
406 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  55.89 
 
 
404 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  54.61 
 
 
401 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  55.84 
 
 
412 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  56.14 
 
 
403 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  53.4 
 
 
404 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  54.64 
 
 
402 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  53.48 
 
 
408 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  54.02 
 
 
411 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  53.63 
 
 
400 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  53.09 
 
 
408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  54.68 
 
 
413 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  52.91 
 
 
403 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  53.6 
 
 
405 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  45.54 
 
 
403 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  46.75 
 
 
405 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  49.75 
 
 
413 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0939  threonine dehydratase  52.6 
 
 
399 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  44.5 
 
 
403 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  43.39 
 
 
403 aa  332  9e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  43.64 
 
 
403 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  45.36 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.88 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.36 
 
 
403 aa  327  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  44.75 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.11 
 
 
403 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.14 
 
 
403 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  40.55 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  40.66 
 
 
402 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  44.89 
 
 
537 aa  319  5e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.63 
 
 
403 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  42.53 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.37 
 
 
408 aa  310  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  47.26 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  46.75 
 
 
401 aa  310  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  46.88 
 
 
403 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  46.75 
 
 
401 aa  310  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  45.89 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.57 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  44.36 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  44.36 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.43 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.61 
 
 
403 aa  302  6.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  42.36 
 
 
402 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  41.85 
 
 
401 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  45.05 
 
 
406 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  42.75 
 
 
403 aa  295  7e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.24 
 
 
404 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  45.9 
 
 
412 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  45 
 
 
403 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.64 
 
 
399 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  45.89 
 
 
402 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  42.64 
 
 
403 aa  292  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45.39 
 
 
411 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  41.84 
 
 
395 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.39 
 
 
413 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40.1 
 
 
401 aa  290  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.25 
 
 
402 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  44.14 
 
 
400 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  44.58 
 
 
415 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  44.39 
 
 
421 aa  286  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  41.83 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  40.15 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  41.48 
 
 
406 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  41.79 
 
 
411 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  46.65 
 
 
410 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  45.76 
 
 
402 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.29 
 
 
410 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  42.37 
 
 
416 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  43.89 
 
 
400 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  44.73 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  40.79 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  37.25 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  45.16 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  43.04 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  41.83 
 
 
412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.24 
 
 
409 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  44.7 
 
 
402 aa  262  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  45.18 
 
 
333 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  45.18 
 
 
333 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  47.48 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  45.18 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.51 
 
 
320 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  45.18 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  45.45 
 
 
442 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.67 
 
 
418 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  44.88 
 
 
333 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  48.11 
 
 
333 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  44.88 
 
 
333 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.7 
 
 
402 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  48.11 
 
 
333 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  42.36 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  38.39 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  41.32 
 
 
412 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>