More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1373 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  100 
 
 		 537 aa  1083    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  74.56 
 
 		 403 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  68.58 
 
 		 403 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  68.08 
 
 		 403 aa  559  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  68.58 
 
 		 403 aa  557  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  67.83 
 
 		 403 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  67.74 
 
 		 403 aa  552  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  73.2 
 
 		 403 aa  547  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  72.7 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  59.7 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.91 
 
 		 403 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  45.34 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 403 aa  343  5e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  50.63 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  50.63 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  45.61 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  45.41 
 
 		 403 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.91 
 
 		 403 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  44.61 
 
 		 402 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.28 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 402 aa  321  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  43.58 
 
 		 403 aa  318  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 413 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.89 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.14 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.5 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  44.22 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 401 aa  312  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 402 aa  310  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  44.47 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.43 
 
 		 402 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 400 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 400 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 395 aa  302  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 406 aa  302  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  42.11 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.24 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.47 
 
 		 403 aa  300  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.96 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 412 aa  294  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  43.08 
 
 		 402 aa  294  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  42.07 
 
 		 408 aa  293  6e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 404 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  45.59 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  47.15 
 
 		 402 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 403 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.94 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  45.34 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 402 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.1 
 
 		 418 aa  286  9e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  43 
 
 		 421 aa  283  6.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  44 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  43.62 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.05 
 
 		 404 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 399 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 399 aa  277  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  41.3 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  44 
 
 		 402 aa  276  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.68 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.6 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  42.06 
 
 		 408 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.38 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 415 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  38.37 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  38.8 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  40.43 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  39.65 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 407 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  37.86 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  39 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  39.79 
 
 		 507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  38.65 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 403 aa  253  6e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  40.75 
 
 		 526 aa  253  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.13 
 
 		 415 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  38.24 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  45.2 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  45.2 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 421 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  37.99 
 
 		 413 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  39.11 
 
 		 416 aa  249  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 402 aa  249  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 504 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  40.54 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>