More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0944 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  100 
 
 		 395 aa  792    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  65.73 
 
 		 401 aa  521  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  51.94 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  51.94 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  54.9 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  52.44 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  47.98 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  48.33 
 
 		 402 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  47.98 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  47.98 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  48.17 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  44.59 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 421 aa  348  7e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  47.56 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  45.38 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  44.73 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  44.59 
 
 		 403 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  44.59 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  44.59 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  47.68 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  47.68 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44.59 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.3 
 
 		 402 aa  319  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  44.13 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  44.87 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45.7 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.97 
 
 		 404 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.59 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.54 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  45.36 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  43.28 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  45.45 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.98 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  45.41 
 
 		 404 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  44.47 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  45.33 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.59 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.9 
 
 		 402 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.92 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  43.51 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  43.12 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  46.51 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  40 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.09 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.13 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.24 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  42.19 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  45.01 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  39.64 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  42.56 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.31 
 
 		 412 aa  282  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  44.93 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  43.96 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  40.46 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  42.37 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.81 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 402 aa  275  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40.11 
 
 		 504 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.11 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.87 
 
 		 514 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.93 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.6 
 
 		 514 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  39.53 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.09 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  40.61 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  40 
 
 		 511 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  40.87 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.22 
 
 		 408 aa  268  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  41.22 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.58 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.22 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  42.23 
 
 		 503 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  40.11 
 
 		 504 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.9 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.9 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 443 aa  265  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36.76 
 
 		 509 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.03 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  38.93 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.4 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.56 
 
 		 515 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>