More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3770 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  100 
 
 		 412 aa  807    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  73.25 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  71.82 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  71.11 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  71.57 
 
 		 399 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  73.82 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  71.32 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  71.32 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  69.9 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  55.58 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  50.62 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  51.84 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  51.72 
 
 		 421 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  52.68 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  53.12 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  53.37 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  47.64 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  51.95 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  48.64 
 
 		 403 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  48.27 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  48.89 
 
 		 403 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  48.4 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  47.15 
 
 		 398 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  41.75 
 
 		 404 aa  326  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  43.64 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  50.91 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  48.38 
 
 		 425 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  48.7 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  43.56 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  47.28 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  44.04 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  42.43 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.79 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  47.75 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  46.53 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  44.65 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.65 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  43.89 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  45.97 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  44.17 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  44.17 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  44.55 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 402 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  43.7 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  46.97 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  39.11 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  46.35 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  42.08 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  45.68 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  48.63 
 
 		 412 aa  272  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.91 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  37.16 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  44.65 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.41 
 
 		 402 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  47.34 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 401 aa  262  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  42.79 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  40.65 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  47.21 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  43 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  46.7 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 402 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  43.19 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  45.83 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45.21 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  43.8 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.35 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  41.09 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  44.83 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.16 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.71 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  41.95 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  42 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.15 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  42.16 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  36.95 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  41.77 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.4 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  43.68 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  42.28 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  39.51 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  45.91 
 
 		 403 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  43.89 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  38.6 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  43.77 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>