More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3784 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  100 
 
 		 402 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  97.26 
 
 		 402 aa  739    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  76.87 
 
 		 402 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  75.62 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  72.14 
 
 		 402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  66.33 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  59.09 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  51.89 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  49.1 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  46.52 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  47.62 
 
 		 400 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  44.64 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  48.14 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  47.68 
 
 		 403 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  48.76 
 
 		 403 aa  335  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.58 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  44.5 
 
 		 403 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  48.45 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  48.2 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  47.42 
 
 		 403 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.52 
 
 		 403 aa  319  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  45.15 
 
 		 402 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  48.01 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  48.01 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  46.33 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  47.98 
 
 		 416 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.09 
 
 		 537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  46.19 
 
 		 403 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  49.36 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  48.35 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.94 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.2 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  45.38 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  46.92 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  45.34 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.96 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  46.97 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.54 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 401 aa  289  7e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.22 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  46.42 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  44.81 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.73 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  44.92 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  46.95 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  45.01 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  44.39 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.43 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  46.7 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  44.36 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  48.37 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.62 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  43.8 
 
 		 415 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  42.46 
 
 		 402 aa  272  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  45.96 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.53 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.94 
 
 		 320 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.78 
 
 		 409 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  45.43 
 
 		 411 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  52.58 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.96 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  44.07 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  42.74 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.13 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  43.38 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  41.05 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  46.61 
 
 		 413 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  44.65 
 
 		 415 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  40.61 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  46.37 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  46.37 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  45.33 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  43.77 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  42.09 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  45.06 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.38 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  48.38 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  48.38 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  48.38 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  48.38 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>