More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3436 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  65.48 
 
 
504 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  62.5 
 
 
509 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  65.4 
 
 
515 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  65.8 
 
 
507 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  65.67 
 
 
514 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  68.25 
 
 
504 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  64.02 
 
 
501 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  65.8 
 
 
511 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  65.67 
 
 
504 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  67.26 
 
 
504 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  65.67 
 
 
504 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  60.52 
 
 
509 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  65.67 
 
 
504 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  60.12 
 
 
507 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  67.06 
 
 
504 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  60.99 
 
 
506 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  64.48 
 
 
503 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  62.93 
 
 
520 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  63.42 
 
 
504 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  66.07 
 
 
504 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  63.13 
 
 
519 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  65.67 
 
 
504 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  68.06 
 
 
504 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  65.2 
 
 
515 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  62.93 
 
 
519 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  100 
 
 
511 aa  1055    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  62.32 
 
 
530 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  62.32 
 
 
504 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  59.44 
 
 
505 aa  620  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  61.12 
 
 
523 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  57.88 
 
 
514 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  58.17 
 
 
507 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  61.83 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  57.79 
 
 
503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  57.57 
 
 
507 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  60.2 
 
 
515 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  57.17 
 
 
507 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  57.26 
 
 
502 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  58.51 
 
 
510 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  57.8 
 
 
503 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  56.97 
 
 
507 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  56.46 
 
 
503 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  57.94 
 
 
510 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  56.77 
 
 
507 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  58.65 
 
 
507 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  56.44 
 
 
506 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  56.44 
 
 
506 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  57.77 
 
 
512 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  58.13 
 
 
550 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  58.33 
 
 
511 aa  588  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  58.92 
 
 
514 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  55.47 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  58.02 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  61.63 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  57.72 
 
 
515 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  57.57 
 
 
507 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  57.72 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  57.26 
 
 
507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  55.56 
 
 
501 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  56.1 
 
 
531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  54.21 
 
 
549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  52.53 
 
 
514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  52.84 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  57.26 
 
 
507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  53.23 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  54.95 
 
 
545 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  57.31 
 
 
505 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  56.37 
 
 
507 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  54.12 
 
 
515 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  55.86 
 
 
516 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  56.18 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  56.18 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  56.86 
 
 
507 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  56.75 
 
 
524 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  56.18 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  56.55 
 
 
524 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  56.06 
 
 
506 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  56.06 
 
 
565 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  56.18 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  56.18 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  52.8 
 
 
527 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  56.06 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  56.06 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  56.11 
 
 
516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  56.06 
 
 
507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  54.31 
 
 
526 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  56.66 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  54.95 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  55.17 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  55.86 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  53.46 
 
 
529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  54.95 
 
 
547 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  55.98 
 
 
507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  54.88 
 
 
531 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  54.88 
 
 
531 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  53.29 
 
 
565 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  54.69 
 
 
536 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  55.86 
 
 
535 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  55.47 
 
 
535 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  54.79 
 
 
519 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>