More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1331 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  100 
 
 		 401 aa  798    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 405 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  51.12 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  51.12 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 403 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.06 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.2 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  42.32 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.71 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  42.11 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  41 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 403 aa  315  6e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  44.13 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  47.01 
 
 		 404 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 408 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  42.35 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  40.35 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  44.02 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  40.4 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  41.65 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  47 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.65 
 
 		 399 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  41.56 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40.89 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  45.18 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  40.3 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  38.56 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.96 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  38.32 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 537 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  40 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  38.5 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.42 
 
 		 410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  39.11 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  48.9 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  48.9 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  38.89 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.79 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 402 aa  278  9e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.57 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.4 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  41.25 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  41.5 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  38.79 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  38.61 
 
 		 412 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  42.29 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  39.21 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  45.4 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  38.64 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  41.07 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  37.16 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  37.53 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  38.32 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.78 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  50.31 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  50.31 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  50.31 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  50 
 
 		 333 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  50 
 
 		 333 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  49.69 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  39.54 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  50.63 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  38.6 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  38 
 
 		 507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  50.32 
 
 		 333 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 404 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>