More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4140 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  100 
 
 		 408 aa  819    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  64.6 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  64.85 
 
 		 414 aa  464  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  56.2 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  47.88 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  47.38 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.95 
 
 		 405 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  40.74 
 
 		 403 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  46.52 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  46.62 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  45.57 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  47.38 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.4 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  42.39 
 
 		 402 aa  302  7.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  47.63 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  47.13 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  45.5 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  41.62 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.94 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.5 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  44.81 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  45.75 
 
 		 404 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.58 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  44.13 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  45.5 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  37.84 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  44 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  44 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.33 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  44.39 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  45.16 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.35 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.83 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  40.89 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.46 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.86 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  43.25 
 
 		 411 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  42.43 
 
 		 402 aa  269  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  41.48 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.22 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.34 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  39.07 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.08 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.08 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  42.15 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  43.18 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 411 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  43.98 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  47.73 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  43.5 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.26 
 
 		 410 aa  255  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 537 aa  255  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  42.29 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  42.19 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  38.4 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  40.25 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  40 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  38.9 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  38.71 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0939  threonine dehydratase  43.57 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.67 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.8 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.8 
 
 		 504 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.95 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  36.86 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  36.97 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  41.73 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  39.32 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>