More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1467 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  100 
 
 
403 aa  802    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  87.5 
 
 
402 aa  650    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  83.08 
 
 
403 aa  662    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  82.75 
 
 
402 aa  629  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  53.1 
 
 
418 aa  412  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  50 
 
 
408 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  48.29 
 
 
403 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  45.94 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  46.28 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.18 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  45.73 
 
 
402 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  46.58 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.44 
 
 
403 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  45.29 
 
 
411 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  47.37 
 
 
403 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  42.22 
 
 
402 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.18 
 
 
403 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  43.34 
 
 
403 aa  296  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.53 
 
 
343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.63 
 
 
404 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  48.87 
 
 
401 aa  288  9e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  48.87 
 
 
401 aa  288  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  40.36 
 
 
403 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44.75 
 
 
403 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  46.15 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  43.6 
 
 
408 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.85 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  39.85 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.92 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  42.12 
 
 
402 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.45 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  44.8 
 
 
403 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.98 
 
 
402 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.52 
 
 
413 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  41.64 
 
 
401 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  47.88 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  42.82 
 
 
415 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  46.98 
 
 
403 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  43.04 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.27 
 
 
403 aa  270  5e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.43 
 
 
403 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  45.38 
 
 
416 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  48 
 
 
410 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.12 
 
 
395 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  43.1 
 
 
400 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.68 
 
 
406 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  50.16 
 
 
358 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  46.63 
 
 
402 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.76 
 
 
404 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45.05 
 
 
411 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  44.88 
 
 
410 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  46.53 
 
 
402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  38.8 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  44.93 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.53 
 
 
399 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  43.52 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.28 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.31 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  44.02 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.3 
 
 
403 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  44.24 
 
 
412 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  42.35 
 
 
421 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  41.51 
 
 
403 aa  250  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  45.91 
 
 
405 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  42.82 
 
 
443 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  38.4 
 
 
409 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  42.56 
 
 
412 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.79 
 
 
403 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  43.27 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40.87 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.38 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  45.03 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  41.29 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  41.62 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.11 
 
 
537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  38.99 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  41.14 
 
 
412 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  45.87 
 
 
407 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  40.8 
 
 
402 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.08 
 
 
401 aa  242  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  43.35 
 
 
416 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.54 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  41.38 
 
 
415 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  43.46 
 
 
442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  43.46 
 
 
404 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  41.49 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  41.49 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  41.71 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  46.24 
 
 
410 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  43.06 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  43.35 
 
 
415 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  44.09 
 
 
410 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.64 
 
 
415 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  42.59 
 
 
422 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  40.84 
 
 
405 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  40 
 
 
411 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  40.58 
 
 
402 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  41.19 
 
 
503 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  43.23 
 
 
402 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  43.17 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>