More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2619 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2619  threonine dehydratase  100 
 
 		 337 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  76.16 
 
 		 520 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  76.62 
 
 		 515 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  76.31 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  76.6 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  72.9 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  73.21 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  75.68 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  75.76 
 
 		 519 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  75.08 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  73.52 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  74.14 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  74.45 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  74.77 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  73.83 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  73.83 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  73.21 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  73.99 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  72.59 
 
 		 504 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  73.83 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  63.84 
 
 		 511 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  64.24 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  63.44 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  63.55 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  62.58 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  57.68 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  61.99 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  58.44 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  58.44 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  56.92 
 
 		 507 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  57.73 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  58.99 
 
 		 501 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  57.19 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  57.1 
 
 		 526 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  58.18 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  58.68 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  60.25 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  57.73 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  57.55 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  57.36 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  60 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 507 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  56.25 
 
 		 507 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  59.62 
 
 		 504 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  59.06 
 
 		 510 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  58.33 
 
 		 514 aa  362  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  58.46 
 
 		 550 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 507 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  60.25 
 
 		 511 aa  361  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  56.07 
 
 		 549 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  57.55 
 
 		 512 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  60.94 
 
 		 509 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  52.81 
 
 		 511 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  53.12 
 
 		 511 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  65.33 
 
 		 507 aa  355  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  55.73 
 
 		 565 aa  355  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 509 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  56.27 
 
 		 523 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  59.69 
 
 		 514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  59.81 
 
 		 515 aa  352  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  57.86 
 
 		 502 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  57.01 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  51.88 
 
 		 514 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  58.13 
 
 		 505 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  57.19 
 
 		 506 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  52.65 
 
 		 513 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  58.13 
 
 		 520 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 514 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  58.13 
 
 		 520 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  57.5 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  56.92 
 
 		 516 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  57.49 
 
 		 531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  56.88 
 
 		 510 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  56.62 
 
 		 524 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  59.06 
 
 		 516 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  56.31 
 
 		 524 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  52.28 
 
 		 517 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  57.5 
 
 		 507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  56.88 
 
 		 535 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  55.9 
 
 		 507 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  56.07 
 
 		 519 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  58.04 
 
 		 504 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 507 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  55.94 
 
 		 507 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 507 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  55.62 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  51.67 
 
 		 517 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  55.31 
 
 		 527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  55.59 
 
 		 507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  56.07 
 
 		 517 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  55.11 
 
 		 535 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  57.06 
 
 		 516 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>