More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4161 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  84.32 
 
 		 536 aa  868    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 545 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  100 
 
 		 516 aa  1054    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  89.51 
 
 		 516 aa  929    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  92.83 
 
 		 516 aa  946    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  84.32 
 
 		 531 aa  869    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  90.7 
 
 		 516 aa  927    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 517 aa  856    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  84.7 
 
 		 531 aa  871    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  84.32 
 
 		 531 aa  867    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  84.51 
 
 		 531 aa  870    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  86.11 
 
 		 557 aa  868    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  86.11 
 
 		 557 aa  868    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  83.98 
 
 		 523 aa  882    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  81.91 
 
 		 531 aa  843    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  85.71 
 
 		 547 aa  863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  61.45 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  62.05 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  62.65 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  60.64 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  59.04 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  62.25 
 
 		 514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  63.25 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  60.24 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  63.25 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  59.52 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  63.25 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  58.77 
 
 		 522 aa  598  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  60.04 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  61.85 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  61.8 
 
 		 511 aa  598  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  61.65 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  58.92 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  58.25 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  58.92 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  61.04 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  58.3 
 
 		 516 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  60.84 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 515 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  56.11 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  60.84 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  59.24 
 
 		 509 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  57.63 
 
 		 520 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  57.72 
 
 		 506 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  57.03 
 
 		 501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  55.8 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  55.8 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  59.32 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  59.52 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  59.12 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  59.12 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  56.74 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  57.65 
 
 		 515 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  58.33 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  55.71 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  58.32 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  58.52 
 
 		 514 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  57.11 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  57.37 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  57.31 
 
 		 523 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  54.51 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  55.14 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  54.85 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  56.8 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  57.92 
 
 		 504 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  58.03 
 
 		 519 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  55.67 
 
 		 503 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  54.91 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  57.46 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 519 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  54.26 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  54.06 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  57.83 
 
 		 530 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  54.13 
 
 		 527 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  56.51 
 
 		 504 aa  551  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  54.06 
 
 		 507 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  56.6 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  53.68 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  56.6 
 
 		 550 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  53.51 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  53.28 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  55.02 
 
 		 504 aa  545  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  54.69 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.06 
 
 		 514 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 520 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  57.4 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>