More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0951 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0778  threonine dehydratase  75.82 
 
 		 517 aa  793    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  100 
 
 		 517 aa  1066    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  97.49 
 
 		 517 aa  1048    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  52.79 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  53.18 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  51.84 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  51.54 
 
 		 504 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  51.84 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  52.12 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  51.54 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  51.84 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  50.68 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  51.56 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  50.68 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  52.7 
 
 		 504 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  52.32 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  52.12 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  52.32 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  52.04 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  51.54 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  52.6 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  52.9 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  50.67 
 
 		 545 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  50.87 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  52.02 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  50.97 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  49.9 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  50.97 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  51.16 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  50.88 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  49.05 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  53 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 515 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  51.66 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  51.56 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  52.6 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  50.77 
 
 		 531 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  51.36 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  50.97 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  51.17 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  49.32 
 
 		 526 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  52.72 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  52.03 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  50.1 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  49.42 
 
 		 501 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  50.77 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  49.13 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  51.45 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  51.36 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  51.45 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  51.45 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  50.39 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  50 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  50 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  51.74 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  51.26 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  51.26 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  51.06 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  51.45 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  51.06 
 
 		 536 aa  488  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  50.48 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  50.78 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  50.78 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  48.85 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  50.78 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  48.68 
 
 		 529 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  50.38 
 
 		 523 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  50 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  49.81 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  45.52 
 
 		 511 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  49.42 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  47.81 
 
 		 527 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  50.38 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  48.57 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  45.52 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  47.05 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  48.76 
 
 		 506 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  49.9 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  50.1 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  48.37 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  49.42 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  45.33 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  47.62 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  47.32 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>