More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4056 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 514 aa  874    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  84.44 
 
 		 514 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  64.27 
 
 		 511 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  100 
 
 		 514 aa  1047    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  86.77 
 
 		 514 aa  892    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  85.02 
 
 		 514 aa  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 514 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  84.24 
 
 		 514 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  70.18 
 
 		 510 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  69.9 
 
 		 515 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  71.77 
 
 		 510 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  89.69 
 
 		 514 aa  922    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 514 aa  880    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  83.85 
 
 		 514 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 514 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  87.35 
 
 		 514 aa  900    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 514 aa  874    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 515 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  100 
 
 		 514 aa  1047    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  83.85 
 
 		 514 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  84.44 
 
 		 514 aa  874    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  85.02 
 
 		 514 aa  882    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  86.38 
 
 		 514 aa  890    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  85.6 
 
 		 515 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  69.88 
 
 		 511 aa  723    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 515 aa  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  87.55 
 
 		 514 aa  903    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  70.29 
 
 		 515 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  100 
 
 		 514 aa  1047    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  64.26 
 
 		 516 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  60.23 
 
 		 545 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  61.98 
 
 		 531 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  62.1 
 
 		 523 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  62.15 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  62.35 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  62.15 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  63.25 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  62.65 
 
 		 517 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  62.15 
 
 		 536 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  61.95 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  61.35 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  61.35 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  61.55 
 
 		 547 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  62.45 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  62.45 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  59.84 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  57.85 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  57.85 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  57.31 
 
 		 509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  55.95 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  55.62 
 
 		 507 aa  568  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  55.91 
 
 		 511 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  55.75 
 
 		 515 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  56.2 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  55.8 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  55.8 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  55.6 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  54.76 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  56.71 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  54.73 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  56.69 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  54.56 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 507 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 507 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  55 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  56.69 
 
 		 519 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  53.51 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  56.49 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  56.46 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  56.49 
 
 		 519 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  54.11 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  54.96 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  56.4 
 
 		 512 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.97 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  53.52 
 
 		 507 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  54.71 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  56.2 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  52.35 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  52.57 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  54.56 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  53.57 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  53.47 
 
 		 524 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  54.6 
 
 		 504 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  53.61 
 
 		 506 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  51.17 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  53.61 
 
 		 506 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  53.6 
 
 		 504 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  53.66 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  53.77 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  53.57 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  54.2 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  53.4 
 
 		 504 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  53.6 
 
 		 504 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  53.97 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  54.04 
 
 		 510 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  52.3 
 
 		 503 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  53.88 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  53.97 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  53.97 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>