More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0349 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  84.6 
 
 
536 aa  883    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  84.24 
 
 
545 aa  874    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  89.15 
 
 
516 aa  919    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  89.51 
 
 
516 aa  928    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  84.41 
 
 
531 aa  879    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  84.22 
 
 
531 aa  874    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  100 
 
 
516 aa  1057    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  84.6 
 
 
531 aa  879    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  83.85 
 
 
517 aa  858    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  91.47 
 
 
516 aa  943    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  84.41 
 
 
531 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  85.4 
 
 
557 aa  863    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  85.4 
 
 
557 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  84.17 
 
 
523 aa  887    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  80.54 
 
 
531 aa  834    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  85.4 
 
 
547 aa  860    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  62.25 
 
 
510 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  63.65 
 
 
514 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  63.86 
 
 
514 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  62.85 
 
 
515 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  64.06 
 
 
514 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  62.25 
 
 
515 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  64.26 
 
 
514 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  64.26 
 
 
514 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  64.26 
 
 
514 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  61.85 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  61.75 
 
 
511 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  62.65 
 
 
514 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  62.65 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  62.25 
 
 
514 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  62.05 
 
 
514 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  61.85 
 
 
514 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  59.96 
 
 
522 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  62.05 
 
 
514 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  62.05 
 
 
514 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  62.05 
 
 
514 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  62.05 
 
 
515 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  61.85 
 
 
515 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  62.05 
 
 
514 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  59.06 
 
 
516 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  61.85 
 
 
514 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  61.85 
 
 
514 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  61.65 
 
 
515 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  61.65 
 
 
514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  58.43 
 
 
507 aa  598  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  61.65 
 
 
514 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  61.65 
 
 
514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  57.85 
 
 
509 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  58.32 
 
 
504 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  57.92 
 
 
504 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  57.72 
 
 
504 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  57.43 
 
 
520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  58.65 
 
 
515 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  55.86 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  58.63 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  57.68 
 
 
515 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  56.11 
 
 
506 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  57.68 
 
 
515 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  57.72 
 
 
504 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  55.94 
 
 
514 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  57.83 
 
 
511 aa  567  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  57.31 
 
 
504 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  57.52 
 
 
504 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  57.52 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  55 
 
 
506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  55 
 
 
506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  55.84 
 
 
501 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  57.85 
 
 
515 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  57.6 
 
 
510 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  55.91 
 
 
523 aa  558  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  57.03 
 
 
504 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  57.72 
 
 
504 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  57.14 
 
 
507 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  56.97 
 
 
511 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  57.83 
 
 
519 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  56.11 
 
 
504 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  57.4 
 
 
512 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  55.86 
 
 
503 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  56.11 
 
 
504 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  57.6 
 
 
550 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.31 
 
 
514 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  57.63 
 
 
519 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  57.31 
 
 
504 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.26 
 
 
514 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  54.71 
 
 
505 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  55.51 
 
 
503 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  57.23 
 
 
530 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  54.51 
 
 
507 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  53.33 
 
 
549 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  53.66 
 
 
507 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  53.47 
 
 
507 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  53.66 
 
 
507 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  53.75 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  53.47 
 
 
507 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  51.76 
 
 
514 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  54.42 
 
 
505 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  53.11 
 
 
526 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  54.4 
 
 
501 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  55.36 
 
 
505 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  55.14 
 
 
510 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>