More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2492 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  70.63 
 
 		 514 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  70.44 
 
 		 514 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  71.77 
 
 		 514 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  70.63 
 
 		 515 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  70.63 
 
 		 515 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  86.71 
 
 		 510 aa  880    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  65.29 
 
 		 511 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  70.83 
 
 		 515 aa  715    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  71.77 
 
 		 514 aa  720    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  70.83 
 
 		 514 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  71.23 
 
 		 514 aa  718    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  70.63 
 
 		 514 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  71.03 
 
 		 514 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  70.92 
 
 		 514 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  71.03 
 
 		 514 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  70.26 
 
 		 514 aa  708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  70.72 
 
 		 514 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  71.77 
 
 		 514 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  100 
 
 		 510 aa  1051    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  71.03 
 
 		 514 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  88.32 
 
 		 515 aa  903    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  70.63 
 
 		 514 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  88.14 
 
 		 515 aa  913    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  70.83 
 
 		 514 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  70.46 
 
 		 514 aa  708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  73.31 
 
 		 514 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  71.03 
 
 		 514 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  66.4 
 
 		 511 aa  677    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  70.44 
 
 		 514 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  62.25 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  60.79 
 
 		 531 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  59.06 
 
 		 545 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  61.45 
 
 		 516 aa  618  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  59.03 
 
 		 523 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  59.96 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  59.37 
 
 		 536 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  59.76 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  59.76 
 
 		 531 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  59.25 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  59.25 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  59.45 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  61.04 
 
 		 516 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  58.23 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  59.37 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  57.91 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  60.24 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  60.44 
 
 		 517 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  58.4 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  57.4 
 
 		 504 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  58.28 
 
 		 504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  57 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  57.52 
 
 		 509 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  55.91 
 
 		 511 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  57 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  56.8 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  57.11 
 
 		 506 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  57.03 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  56.44 
 
 		 520 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  57.03 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  60.88 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  56.51 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  61 
 
 		 514 aa  568  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  56.4 
 
 		 504 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  57.72 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  55.82 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  56 
 
 		 523 aa  558  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  57.4 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  56.83 
 
 		 519 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  55 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  58.2 
 
 		 510 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  56.63 
 
 		 519 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  55.84 
 
 		 530 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  57.52 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  57.2 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  58.2 
 
 		 512 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  55.4 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  55.6 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  55 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  55.2 
 
 		 504 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  58.2 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  55.6 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  56.51 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  56.2 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  53.57 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  55.4 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  54.31 
 
 		 514 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  55.11 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  53.89 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  52.98 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  54.83 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  52.58 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  52.78 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  58 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  52.91 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  54.49 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  52.3 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  57 
 
 		 504 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 502 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  51.57 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>