More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4344 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  84.44 
 
 		 516 aa  857    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  100 
 
 		 545 aa  1117    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  93.99 
 
 		 531 aa  964    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 516 aa  872    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  84.24 
 
 		 516 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  85.6 
 
 		 517 aa  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  93.8 
 
 		 531 aa  963    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  93.99 
 
 		 531 aa  964    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  93.54 
 
 		 557 aa  1021    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  93.54 
 
 		 557 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  83.69 
 
 		 523 aa  880    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  84.82 
 
 		 516 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  95.06 
 
 		 547 aa  1026    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  92.6 
 
 		 536 aa  968    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  93.6 
 
 		 531 aa  958    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  81.66 
 
 		 531 aa  847    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  58.89 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  59.06 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  59.3 
 
 		 515 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  59.35 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  60.23 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  58.97 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  60.23 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  59.66 
 
 		 514 aa  611  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  59.46 
 
 		 515 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  60.23 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  57.87 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  59.08 
 
 		 514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  58.7 
 
 		 514 aa  601  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  598  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  58.21 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  57.81 
 
 		 522 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  58.21 
 
 		 514 aa  598  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  58.4 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  598  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 515 aa  598  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  58.4 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  58.59 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  57.89 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  58.21 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  54.95 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  59.76 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  56.86 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  56.21 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  56.21 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  56.75 
 
 		 504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  56.98 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  55.58 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  55.12 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  56.97 
 
 		 511 aa  566  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  56.4 
 
 		 515 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  57.59 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  56.65 
 
 		 515 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  54.42 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  54.42 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  54.65 
 
 		 506 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 504 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  53.88 
 
 		 505 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  56.61 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  54.36 
 
 		 523 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  55.82 
 
 		 504 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  55.62 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  54.83 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  54.47 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  55.62 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  53.86 
 
 		 527 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  53.19 
 
 		 565 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  55.6 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  55.23 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  50.75 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  54.58 
 
 		 504 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  55.06 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  55.17 
 
 		 519 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  52.96 
 
 		 514 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  55.17 
 
 		 530 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  54.78 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  55.03 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  56.15 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  52.38 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  54.44 
 
 		 504 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  52.73 
 
 		 507 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  52.75 
 
 		 515 aa  538  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  55.17 
 
 		 519 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  52.34 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  52.88 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  51.87 
 
 		 503 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  52.15 
 
 		 507 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  51.27 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  53.97 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  54.18 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  52.21 
 
 		 529 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  55.31 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  50.19 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  51.95 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>