More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2318 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  98.65 
 
 		 530 aa  1043    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  75.2 
 
 		 504 aa  765    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  74.6 
 
 		 504 aa  788    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  75.6 
 
 		 507 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  74.51 
 
 		 514 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  75 
 
 		 515 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  62.93 
 
 		 511 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  76.33 
 
 		 511 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  76.39 
 
 		 504 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  94.23 
 
 		 520 aa  1001    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  62.9 
 
 		 509 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  74.6 
 
 		 504 aa  760    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  75.4 
 
 		 504 aa  765    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  100 
 
 		 519 aa  1054    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  75.4 
 
 		 504 aa  766    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  96.92 
 
 		 519 aa  997    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  75.99 
 
 		 504 aa  775    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  74.6 
 
 		 504 aa  757    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  74.21 
 
 		 504 aa  765    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  74.4 
 
 		 504 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  74.17 
 
 		 515 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  61.14 
 
 		 503 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  63.33 
 
 		 506 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  60.64 
 
 		 504 aa  628  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  58.93 
 
 		 503 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  60.64 
 
 		 501 aa  618  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  59.36 
 
 		 506 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  59.36 
 
 		 506 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  62.5 
 
 		 509 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  61.45 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  57.17 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  57.46 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  61.43 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  57 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  59.17 
 
 		 514 aa  594  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  59.44 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  57.57 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  55.95 
 
 		 507 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  57.34 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  61.35 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  61.16 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  59.96 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  59.76 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  59.84 
 
 		 523 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  59.96 
 
 		 550 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  57.06 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  56.8 
 
 		 526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  56.22 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  60.84 
 
 		 504 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  57.42 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  60.99 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  56.13 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  54.9 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  54.44 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  55.67 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  53.73 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  56.06 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  55.67 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  55.86 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  55.36 
 
 		 506 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  55.56 
 
 		 506 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  53.32 
 
 		 527 aa  558  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  55.84 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  56.63 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  56.47 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  54.44 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  57.63 
 
 		 516 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  57.37 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  53.56 
 
 		 506 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  55.36 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  56.44 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  54.15 
 
 		 506 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  55.03 
 
 		 524 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  54.95 
 
 		 515 aa  547  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  50.29 
 
 		 514 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  55.16 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  55.27 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  55.27 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  55.56 
 
 		 535 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  54.6 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  54.27 
 
 		 516 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  56.74 
 
 		 503 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  55.07 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  55.06 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  55.07 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  50.68 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  50.88 
 
 		 511 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  55.07 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  55.22 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  56.37 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  54.87 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  55.07 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  55.07 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  53.83 
 
 		 535 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  55.86 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  53.92 
 
 		 535 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  54.42 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  55.45 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>