More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0299 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  64.97 
 
 
513 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  64.97 
 
 
513 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  66.54 
 
 
513 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  100 
 
 
511 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  67.98 
 
 
509 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  67.78 
 
 
509 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  99.02 
 
 
511 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  65.36 
 
 
515 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  70.84 
 
 
514 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  61.54 
 
 
502 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  73.97 
 
 
514 aa  791    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  59.84 
 
 
503 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  57 
 
 
507 aa  611  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  55.51 
 
 
503 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  55.4 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  57.65 
 
 
519 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  57.25 
 
 
565 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  54.79 
 
 
507 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  54.24 
 
 
526 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  55.42 
 
 
503 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  57.45 
 
 
506 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  54.74 
 
 
501 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  54.4 
 
 
507 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  57.65 
 
 
506 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  54.4 
 
 
507 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  54.6 
 
 
507 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  54.21 
 
 
504 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  54.58 
 
 
524 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  54.69 
 
 
507 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  54.07 
 
 
549 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  54 
 
 
524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  58.46 
 
 
503 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  53.82 
 
 
504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  55.77 
 
 
510 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  54.1 
 
 
535 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  52.84 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  53.63 
 
 
506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  54.4 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  53.61 
 
 
535 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  52.38 
 
 
529 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  53.32 
 
 
515 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  54.21 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  54.01 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  54.79 
 
 
507 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  53.61 
 
 
535 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  56.16 
 
 
509 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  53.41 
 
 
535 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  54.31 
 
 
507 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  51.74 
 
 
527 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  54.99 
 
 
506 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  52.93 
 
 
507 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  54.6 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  53.23 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  54.21 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  53.22 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  54.31 
 
 
507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  54.84 
 
 
519 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  53.53 
 
 
507 aa  558  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  53.24 
 
 
506 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  53.24 
 
 
506 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  53.42 
 
 
504 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  51.27 
 
 
515 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  54.21 
 
 
504 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  51.27 
 
 
515 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  54.01 
 
 
504 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  53.36 
 
 
501 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  53.58 
 
 
520 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  53.82 
 
 
504 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  53.42 
 
 
504 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  51.64 
 
 
565 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  53.58 
 
 
520 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  53.82 
 
 
504 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  52.84 
 
 
514 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  50.2 
 
 
514 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  52.73 
 
 
606 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  52.64 
 
 
507 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  52.45 
 
 
504 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  51.47 
 
 
527 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  50.49 
 
 
520 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  53.49 
 
 
517 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  52.56 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  53.65 
 
 
523 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  51.57 
 
 
512 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  50.79 
 
 
504 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  52.75 
 
 
514 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  53.62 
 
 
515 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  51.76 
 
 
510 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  50.98 
 
 
509 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  50.59 
 
 
503 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  50.99 
 
 
505 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  51.77 
 
 
550 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  50.88 
 
 
530 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  50.68 
 
 
519 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  49.51 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>