More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0340 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  70.16 
 
 		 506 aa  728    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  89.72 
 
 		 507 aa  950    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  74.55 
 
 		 507 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  72.96 
 
 		 524 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  64.58 
 
 		 565 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  68.19 
 
 		 526 aa  724    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  72.96 
 
 		 507 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  74.55 
 
 		 507 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  65.11 
 
 		 510 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  83.5 
 
 		 519 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  63.15 
 
 		 527 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  61.43 
 
 		 505 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  66.8 
 
 		 503 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  74.16 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  72.37 
 
 		 535 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  66.8 
 
 		 517 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  74.95 
 
 		 507 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  65.83 
 
 		 529 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  62.25 
 
 		 503 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  72.76 
 
 		 535 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  73.16 
 
 		 535 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  67.45 
 
 		 520 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  68.44 
 
 		 515 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  65.02 
 
 		 503 aa  694    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  67.71 
 
 		 519 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  73.56 
 
 		 524 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  73.56 
 
 		 535 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  75.35 
 
 		 507 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  100 
 
 		 506 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  83.9 
 
 		 565 aa  856    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  74.16 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  71.97 
 
 		 535 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  74.16 
 
 		 507 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  66.14 
 
 		 527 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  74.55 
 
 		 507 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  67.45 
 
 		 520 aa  682    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  66.2 
 
 		 507 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  74.75 
 
 		 507 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  66.6 
 
 		 502 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  74.35 
 
 		 507 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  68.1 
 
 		 549 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  65.81 
 
 		 503 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  99.21 
 
 		 506 aa  1041    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  69.52 
 
 		 501 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  70.16 
 
 		 506 aa  729    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  57.93 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  59.17 
 
 		 504 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  61.26 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  56.36 
 
 		 514 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  57.76 
 
 		 504 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  57.59 
 
 		 509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  57.76 
 
 		 504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  58.58 
 
 		 506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 515 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  58.55 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  58.35 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  57.65 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  57.65 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  58.55 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  57.23 
 
 		 514 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  54.99 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  54.99 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  57.03 
 
 		 515 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  57.53 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  58.15 
 
 		 504 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  57.76 
 
 		 504 aa  588  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  58.51 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  56.06 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  56.15 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  57.96 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  58.55 
 
 		 504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  55.38 
 
 		 507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  56.26 
 
 		 523 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.17 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  56.78 
 
 		 504 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  54.64 
 
 		 503 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  59.21 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  57.23 
 
 		 507 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  56.83 
 
 		 511 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  58.93 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  55.03 
 
 		 606 aa  562  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  55.38 
 
 		 505 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  55.93 
 
 		 512 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  55.36 
 
 		 530 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  55.36 
 
 		 519 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  55.36 
 
 		 519 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  57.74 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  56.86 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  51.47 
 
 		 513 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  56.94 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  56.55 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  56.35 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  53.23 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  53.03 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>