More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  92.19 
 
 		 320 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  59.35 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  60.06 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  60.38 
 
 		 333 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  59.94 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  58.81 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  64.21 
 
 		 334 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  57.05 
 
 		 330 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  58.84 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  58.6 
 
 		 323 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  57.7 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  58.1 
 
 		 339 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  56.19 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  58.15 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  56.77 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  54.17 
 
 		 318 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  49.53 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.71 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  32.27 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  32.15 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  31.7 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  31.37 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  31.37 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  32.8 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.83 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.69 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  36.12 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  35 
 
 		 405 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  32.57 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  36.18 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  29.38 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  34.11 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  33.22 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  31.44 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  31.66 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  30.99 
 
 		 404 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  31.38 
 
 		 510 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  33.01 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  33.76 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  33.12 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  32.8 
 
 		 510 aa  136  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.27 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  31.1 
 
 		 514 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  32.5 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.16 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  30.43 
 
 		 514 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  32.67 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  31.02 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  32.05 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  30 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  30 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  35.33 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  30.1 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.62 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  30.63 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  33.56 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  33.56 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.29 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 515 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.9 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  30.77 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  34.06 
 
 		 403 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  30.77 
 
 		 514 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  29.15 
 
 		 515 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  32.8 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  31.13 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  32.4 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.27 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 516 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  31.82 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  33.9 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  35.07 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  30.56 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  30.77 
 
 		 511 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  30.23 
 
 		 515 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  31.68 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  37.26 
 
 		 411 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  29.57 
 
 		 514 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>