More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4245 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  76.66 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  71.43 
 
 		 325 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  71.43 
 
 		 324 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  59.27 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  57.78 
 
 		 323 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  58.99 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  56.51 
 
 		 320 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  56.19 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  58.01 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  53.77 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  58.98 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  53.04 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  51.3 
 
 		 321 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  52.79 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  50.8 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  52.13 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  48.39 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  47.39 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.81 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  32.53 
 
 		 516 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  35.47 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.03 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  32.13 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.48 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  31.37 
 
 		 403 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  31.25 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  29.78 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  29.47 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.33 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  29.47 
 
 		 403 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  31.65 
 
 		 515 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  28.52 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.83 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  26.75 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  30.67 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 510 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  31.65 
 
 		 415 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  31.78 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  33.65 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  31.53 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  32.2 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  31.12 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  29.04 
 
 		 515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  32.2 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  31.6 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  28.44 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  31.41 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  29.79 
 
 		 514 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  29.79 
 
 		 514 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  30.09 
 
 		 514 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  29.67 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  29.09 
 
 		 515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  29.67 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  29.67 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  32.77 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  29.48 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  29.67 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  29.72 
 
 		 515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  32.31 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  31.51 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  29.38 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  29.38 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  29.38 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  29.6 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  29.79 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  29.38 
 
 		 515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  31.6 
 
 		 504 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  30.1 
 
 		 504 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  31.14 
 
 		 504 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  31.27 
 
 		 504 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  29.38 
 
 		 514 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  31.6 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  30.61 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  32.13 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.54 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  30.61 
 
 		 511 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  31.72 
 
 		 505 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  30.66 
 
 		 507 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  29.55 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  28.3 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  28.97 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  31.8 
 
 		 515 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  31.27 
 
 		 504 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  28.97 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  27.95 
 
 		 514 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  30.13 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  33.68 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  32.89 
 
 		 410 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  32.06 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  25.79 
 
 		 406 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  31.53 
 
 		 501 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  29.9 
 
 		 523 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.58 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  32.27 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>