More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2225 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  65.61 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  58.54 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  61.71 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  58.73 
 
 		 316 aa  344  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  58.47 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  58.47 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  55.77 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  59.37 
 
 		 323 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  54.17 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  55.63 
 
 		 321 aa  311  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  52.9 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  51.13 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  51.13 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  54.7 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  52.05 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  50.48 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  48.39 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  49.84 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  49.52 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  36.56 
 
 		 400 aa  185  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.38 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  37.72 
 
 		 415 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  32.7 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.94 
 
 		 403 aa  172  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.48 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  34.5 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.4 
 
 		 405 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.83 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.17 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.98 
 
 		 402 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  36.12 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  33.12 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 408 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  34.34 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  35.45 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  36.94 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  35.45 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  35.45 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  34.68 
 
 		 515 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.73 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 510 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  33 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 514 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.99 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 403 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  33.23 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  31.88 
 
 		 507 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  33.56 
 
 		 514 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  34.88 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  34.88 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  34.45 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  33.78 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  32.66 
 
 		 515 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  33.65 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 514 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.09 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  33.44 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.97 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 514 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  34.68 
 
 		 514 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  34.68 
 
 		 514 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  34.68 
 
 		 514 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  31.99 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  33.12 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  32.48 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  33.09 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.02 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  35.74 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.31 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 515 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  31.1 
 
 		 511 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  34.52 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  36.05 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  35.23 
 
 		 516 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  34.27 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.29 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 515 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>