More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4126 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 333 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  42.09 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.56 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  40.38 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3117  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  40 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00803361  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  33.03 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.29 
 
 		 404 aa  175  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  36.53 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.25 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  38.8 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  39.69 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.28 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  32.81 
 
 		 400 aa  168  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  40.58 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  37.2 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  39.38 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  40.55 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  30.7 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  38.3 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  35.38 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  30.7 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  36.42 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  37.54 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  38.27 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  30.4 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  35.9 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  34.35 
 
 		 507 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  29.88 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  36.17 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  36.86 
 
 		 412 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  32.21 
 
 		 401 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  31.9 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  36 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 507 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 507 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.68 
 
 		 511 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3238  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.89 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  30.49 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  34.8 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.43 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.68 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  36.81 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  34.6 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  34.97 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  37.76 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  36.3 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.05 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 503 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  30.36 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  35.67 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.89 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 514 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  35.64 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  37.39 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.54 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  35.64 
 
 		 514 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  32.88 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  32.53 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  36.11 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  34.02 
 
 		 515 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  35.78 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  36.7 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  32.52 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  32.36 
 
 		 514 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  34.35 
 
 		 507 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  33.65 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  33.74 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  31.07 
 
 		 513 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  32.69 
 
 		 504 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  36.39 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  34.52 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  34.73 
 
 		 506 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.73 
 
 		 506 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  34.83 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  33.65 
 
 		 507 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  31.58 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  34.52 
 
 		 504 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 515 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  35.31 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  35.26 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  34.1 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.75 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  32.57 
 
 		 526 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  34.46 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  31.85 
 
 		 549 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  35.45 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>