More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0687 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  68.42 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47.9 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3217  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.33 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555071  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0534  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.36 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.23 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.63 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.01 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  44.44 
 
 		 329 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.03 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  44.74 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.73 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  44.41 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  45.72 
 
 		 324 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  45.57 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  44.74 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  45.72 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  44.74 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  45.72 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  45.25 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3215  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.04 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  46.38 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  46.71 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  44.08 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3470  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.74 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  45.07 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.08 
 
 		 319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.39 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.73 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0152  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.63 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.78 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1894  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.03 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.9 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4565  serine/threonine dehydratase  45.42 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.026373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  44.92 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.41 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  42.62 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4347  serine/threonine dehydratase  45.33 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.98 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  46.38 
 
 		 320 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.12 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1999  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.25 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  0.0256185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.72 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.13 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  46.23 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  46.23 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.45 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1148  putative serine/threonine dehydratase  45.63 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.697315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.94 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.74 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.39 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.51 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 404 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.96 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4888  putative threonine dehydratase, catabolic  38.98 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.66 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0886  serine/threonine dehydratase  46.07 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.22 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.86 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  38.31 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04793  serine/threonine dehydratase  45.42 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.0296686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 403 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 403 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.12 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3108  serine/threonine dehydratase  45.61 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.12 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  42.11 
 
 		 402 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2603  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.5 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000516286  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1660  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.84 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0211382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.86 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.46 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.75 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.09 
 
 		 402 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.77 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  41.39 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  37.99 
 
 		 408 aa  194  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.34 
 
 		 401 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.34 
 
 		 401 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  39.24 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3966  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 338 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.91 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.97 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0781846  normal  0.0456931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  39.93 
 
 		 418 aa  190  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9151  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  42.28 
 
 		 506 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  42.28 
 
 		 506 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 509 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3581  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.42 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.961282  normal  0.253572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>